上述将执政府和大革命政府相联系的做法为文官政府奠定了基石，但却不能保证国外甚至只是国内的持久和平。1803年5月《亚眠和约》（Peaceof Amiens）被撕毁，标志着英法之间恢复敌对。从此，双方在大陆和海洋上的对抗一直持续了12年。人们也许会忽略的是拿破仑统治的早期是岌岌可危的。1800年6月14日的马伦哥战役里法国险些输掉。但对于手工业者和农民大范围的政治骚动，拿破仑不像之前的革命政权那样感到棘手。城市和农村的骚动在督政府晚期已经中止，雾月政变后更是消失无踪，这使得拿破仑能够宣传说人民大众已经服从于他的政权。零零星星的暴力反抗偶有发生，说明还有一些人对新秩序怀有敌意。如同督政府晚期一样，对执政府早期的法律和秩序威胁最大的是各地的劫匪。随着开小差和逃兵役的人四处劫掠，情况就更严重了。
1800年圣诞夜在圣尼凯斯大街（Saint-Nicaise）上企图用诡雷（machine，nfernale）杀害拿破仑的阴谋，因为几秒之差而失败。这本是王党的一次阴谋，但却被蓄意曲解了。结果，1801年1月5日有130名号称雅各宾派和王党的人被流放。1803年至1804年王党分子乔治·卡杜达尔（Georges Cadoudal）刺杀拿破仑的阴谋败露后若干人被处死，包括卡杜达尔本人，而皮什格吕被勒死在监狱里。1804年早期，拿破仑还是认为为了国家的安全必须在境外的巴登（Baden）将孔戴大公（de Cond6）的孙子、曾任逃亡军队指挥官的当甘公爵（ducd'Enghien）逮捕。在文森（Vincennes）进行简单的审讯后，甘当公爵于1804年3月20日被枪决。
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