《南开日本研究（2012）》的办刊宗旨是：以中国的历史发展和当代转型为理论思考的背景，提倡科学方法和人文精神并重，鼓励方法论创新和跨学科研究，俾使中国的日本学研究不致流于空泛而富有参考价值。
　　《南开日本研究（2012）》开设专题研究、比较视窗、海外专稿、学术人物等多种固定和非固定栏目，以期在日本政治、经济、社会、历史、文化以及中日关系等广泛的研究领域内，为中国的日本学研究者提供一个公共学术平台。

日本历史研究
日本近代蔑视型中国观的形成
日本社会研究
非营利组织在日本社会发展中的作用
日本哲学研究
西田几多郎论“逻辑的理解与数理的理解”
近代日本的宗教哲学——真宗大谷派的清泽满之与京都学派的田边元
日本女性研究
女性社会角色的变迁与日本的现代化
试论战后日本的女子教育
日本女子学校之发展考究
海外专稿
日本民族主义中的“美国身影”
“跨越国境的历史”与东亚——从日韩思想史的视域思考

论文
政府温和干预、金融约束与市场体系重建——战后日本的金融发展与金融深化
交易成本与公司治理——以日本股东代表诉讼制度改革为中心
作为“历史的现实”的田边哲学
日本研究学术史
中国日本思想史研究的方法论问题——一种学术史的回顾与展望
日本学人物志
邹有恒先生学问人生评传
稿约