1.合作医疗模式这种模式是我国农村最早也是最重要的，是我国农村社会保险中起主导作用的一种。在我国农村合作医疗制度起起落落的不同时期，曾经出现过福利型、风险型、福利一风险型、合作型，这些不同特点的合作医疗模式，所解决的是农民某一方面的医疗保障问题，不具有普遍性。如福利型只能保小病，不解决大病或重病的问题，这种形式个人和集体交纳的费用少，经济负担不重，但不能有效解决大病风险；风险型只是补偿大病住院费用，主要特点是保大不保小，补偿水平较高，但由于患重病的比例往往占少数，大多数人长期不受益，也必然影响他们继续参保的积极性，降低吸引力。而福利一风险型是在传统合作医疗衰退后出现的，尽管既保大也保小，但是由于受益面较大，筹资标准高筹资难度相应增加，对于大病和重病的补偿有限，保大的作用不明显。因此合作医疗模式在历史上起过一定的作用，但是需要不断改进和完善。
2.新型合作医疗模式
这种模式是合作医疗的继续，也可以说是合作医疗改进和完善的结果，是针对我国经济体制改革后农村的医疗保障困境而确立的，也是我国目前农村的一种主要医疗保障模式。它是由政府组织、引导和支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济性的制度。
新型合作医疗一般以县市为单位进行统筹，以家庭为单位“自愿参加”缴纳合作医疗经费，乡镇和村集体给予资金扶持，中央和地方各级财政每年要安排一定的专项资金给予支持，而且中央财政对参加合作医疗农民的补助标准已经由原来的每人10元提高到每人20元。这种模式的确立有利于从制度上为农民提供基本医疗保障，减轻农民医疗费用的负担，缓解农村因病致贫和看病难问题，有利于促进城乡协调发展。
但在实施过程中也存在一些问题，因此造成目前还有相当一部分农民不能获得医疗保障。新型合作医疗面临着筹资成本高，每年的筹资都需要“合管办”的工作人员挨家挨户并且通过说服的方式来收取，这种现状直接制约着农村合作医疗的较快推广铺开。同时新型合作医疗实行的是政府补贴与自愿参加相结合，就会造成给付结构不合理，贫困家庭因没有能力交费也就不能得到政府的补贴，而富人更有能力交费，也就更有可能享受政府提供的补贴和医疗保障。这造成农村医疗卫生领域的不平等，而这种自愿性难以避免逆向选择，使低风险人群不愿意购买保险，造成保险基金筹集的困难，因此，实行自愿性原则，很难扩大合作医疗的覆盖面。
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