MBS通常分为6层，为了便于理解，我们把MBS简单划分为三层，即高级层、夹层和股本层。假如本金为1亿美元，分配到各个分层的情况是：高级层7500万美元、夹层2000万美元、股本层为500万美元；高级层回报6％、夹层10％、股本层30％。
这种结构充分满足了不同风险偏好投资者的需求。养老金一般都比较保守，感兴趣的都是风险小、高等级MBS，对冲基金寻求高风险、高回报，更偏重选择低等级分层。
表面看来，股本层回报最高，但实际上实现起来很难。资产池产生的现金流从高往低分配。MBS在到期分配本金时，每一层能得到多少本金取决于资产的损失情况。如果发生的损失在5％以内，由股本层承担；如果损失超过5％，股本层损失全部本金，轮到夹层承担部分损失；如果损失超过25％，夹层损失全部本金，超出的损失由高级层承担。
MBS的分配原则主要有两点：一个是产生的现金流分配自高向低；一个是损失承担是自低向高。一般高级层评级为AAA，夹层评级为BBB，股本层不评级，MBS发起方将这些不同分层的证券卖给对冲基金和其他机构投资者时，AAA评级的高级层好卖，股本层高风险、高回报受到对冲基金的偏爱，唯独夹层风险比高级层高、回报比股本层低，不容易卖出去。
这难不倒金融工程师们，他们在MBS夹层基础上又设计出一个MBS，这就是所谓的MBSCDO。MBSCDO高级层是AAA级，这样一来，全部AAA级证券占了本金的90％（75％+20％×75％），还有一些银行将MBSCDO的夹层再做成AAA级，占本金的比例就更高了。
2007年下半年MBS的AAA级层被降级，但如果抵押贷款损失不超过25％，还可以得到所承诺的回报。但对于MBSCDO的AAA级就是另外一回事了，要是损失少于10％还可以得到回报，因为MBS的夹层必须承担5％：MBS本金损失。由于有：MBS本金20％，损失最多5／20或25％，这种情况下，MBSCDO股本和夹层全部损失，只剩下高级层。如果相关资产损失超过10％，高级层也开始受殃及。
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——美国财长盖特纳
从最基本层面分析，这场金融危机是由迅猛增长几十年的影子银行在两年里轰然坍塌所导致的。
——纽联储主席杜德利
我们有一个建立在衍生品上、不受监管的秘密银行体系——影子银行。它囊括了二战结束后商业银行以外的几乎所有金融创新。
——债券之王格罗斯
影子银行与信用衍生品产生的巨大危害被包括众多大牌经济学家和监管当局在内的许多人所忽视。
——沃顿商学院金融系教授艾伦
那些最杰出、最聪明的火箭科学家们向我承诺，创新工具将确保金融体系安然无恙。
——美联储前主席格林斯潘
雇最聪明的人，用最快捷、最安全的方式，让钱生钱，再生更多的钱。
——高盛总裁贝兰克梵
避税天堂最肮脏的秘密在于大部分是披着合法的外衣。
——美国总统奥巴马