本课题研究结合我国创新实际、特别是上海创新实践，总结上海自主创新经验，通过理论分析，找出进一步创新的体制缺陷、环境障碍、政策缺陷，并提出相应的对策建议，为提高我国自主创新能力、建设创新型国家提供理论借鉴。
    本研究重新界定地方政府在城市创新体系中的职责。在前人研究的基础上，提出产学研结合新模式。作者提出城市创新能力评价的基本要素，根据要素特点分别采用定量或定性分析。提出鼓励私募融资参与风投，提倡政府或国有资本参股、外资或民资控股、市场运作的运行新模式。

    第一章  导论
    第一节  自主创新概念与创新理论的研究
    一、自主创新的内涵
    中文“创新”一词一般包括三层含义，即发现、发明和革新。发现与科学相关联，指发现已经存在但不为人知的规律、法则或结构和功能。发明与技术和工艺相关联，是根据发现的原理而进行制造或运用，产生出一种新的物质或行动。革新即提出与前人不同的新思想、新学说、新观点，创立与前人不同的经济体制、企业制度等。
    1．自主创新的界定
    自主创新是指通过拥有自主知识产权的独特的核心技术以及在此基础上实现新产品的价值的过程。中国共产党第十六届五中全会通过的《中共中央关于制定国民经济和社会发展第十一个五年规划的建议》指出，自主创新包括原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新。原始创新是指前所未有的重大科学发现、技术发明、原理性主导技术等创新成果，是获得新的科学发现、新的理论、新的方法和更多的技术发明。集成创新是指通过对各种现有技术的有效集成，形成有市场竞争力的产品或者新兴产业。引进消化吸收再创新则指在引进国内外先进技术的基础上，学习、分析、借鉴，进行再创新，形成具有自主知识产权的新技术。
    从学术界研究的现状来看，对自主创新内涵的理解主要有以下几种观点：
    （1）在理解自主创新时，不仅在外延上做TN确的界定，而且对其内涵也做了更为广义的解释。谢燮正（1995）指出，自主创新不同于技术创新。过去的技术创新省略了许多由发明到应用的中间环节，失败风险很小，所以进行的主要是学习消化，至多做一点适应性修改；自主创新则不然，必须包括选择发明和科技成果，使之逐步成熟到适合于生产应用，以至于市场成功，还必须包括根据市场和生产需要去开发技术的各种努力。

第一章  导论
第一节  自主创新概念与创新理论的研究
一、自主创新的内涵
二、创新型国家、创新型城市和创新型企业研究
三、创新理论与创新政策研究

第二节  上海自主创新的实践和探索
一、实施“三个聚焦”，抢占战略制高点
二、通过“三个加强”，突破创新瓶颈
三、整合资源，优化创新基础条件
四、提供保障，制定创新政策法规
五、加强科普，营造创新文化氛围

第三节  上海自主创新的障碍
一、体制障碍
二、环境障碍
三、政策障碍

第四节  完善创新环境、机制和政策
一、构建城市创新体系，完善创新市场社会环境
二、培育创业、创新和创造的文化环境
三、构建有利于自主创新的制度安排
四、完善创新支持政策
第五节  《创新的瓶颈与突破》内容框架结构

第二章  上海自主创新能力的现状与评估
第一节  现状与潜力
一、创新能力的现状
二、发展潜力与目标

第二节  构建创新型城市的中外比较
一、上海与发达国家城市的比较
二、上海与国内创新型城市的比较

第三节  完善城市自主创新评价和考核体系
一、《上海市科教兴市指标体系》分析
二、城市创新能力评价体系

第三章  自主创新与企业的内生动力
第一节  激发企业的内动力
一、企业核心竞争力在于创新力
二、“创新”能不能“落地”在于企业
三、国有重点骨干企业可以发挥重要作用

第二节  内生动力的要素
一、市场规模、技术积累、利益分配是原初动力
二、企业家、科技骨干和企业员工是自生动力
三、政策导向、制度保障、文化支撑是助推力

第三节  创新要素的集聚
一、国家发展战略和企业发展战略
二、外部创新环境和企业内部创新机制
三、产、学、研、用战略联盟及其有序分工

第四章  上海国有企业自主创新的体制机制建设
第一节  国企自主创新的历史沿革和现状分析
一、历史沿革
二、现状分析

第二节  上海国有企业自主创新体制机制问题的分析
一、自主创新的体制环境尚未成熟
二、自主创新的内部机制尚未完善
三、产学研合作机制尚未形成

第三节  上海国企自主创新体制机制建设的对策分析
一、完善体制环境
二、建立企业内部激励机制
三、完善企业的产学研合作机制

第四节  上海国有企业自主创新实例
一、上海纺织控股集团实施科技市场化政策
二、上海发电设备成套设计研究院自主创新之路

第五章  民营企业自主创新的体制、政策和市场环境建设
第一节  上海民企自主创新的自身瓶颈与障碍
一、动力机制不完善，自主创新意识薄弱
二、风险分担机制不健全
三、人才匮乏，研发能力有限
四、企业规模及产业分布是限制自主创新的重要因素

第二节  上海民企自主创新的外部瓶颈与障碍
一、准入许可对民营企业自主创新构成限制
二、民营企业创新缺乏行而有效的政策支持
三、民营企业自主创新融资困难
四、技术溢出效应及知识产权保护不力阻碍创新
五、有利于科技成果转化的机制尚未真正形成

第三节  完善民企自主创新的制度、政策和环境对策研究
一、提升自身自主创新能力的对策建议
二、完善创新外部环境的对策建议

第六章  上海科技体制改革和科研院所自主创新
第一节  上海科技体制改革历程
一、上海科技体制改革从起步到全面推开
二、科技改革的深化

第二节  上海科研院所自主创新的现状及面临的问题
一、上海科研院所自主创新的现状
二、上海科研院所自主创新面临的问题

第三节  不断完善科研院所自主创新的制度、政策和市场环境
一、国外科技体制发展动向
二、完善科研院所自主创新制度、政策与环境的思路和举措

第七章  加快上海自主创新的市场环境建设
第一节  建立与健全市场体系，完善自主创新市场交易环境
一、加快发展技术市场建设
二、大力推进多层次资本市场体系建设

第二节  培育社会中介机构，创建有利于自主创新的市场服务环境
一、发展科技中介机构是促进自主创新的重要保障
二、培育科技中介机构，构建自主创新活动平台

第三节  加强知识产权保护，完善自主创新的市场制度环境
一、知识产权与自主创新
二、实施国家知识产权保护战略

第八章  完善上海自主创新激励政策
第一节  创新政策分类和选择
一、创新政策分类
二、创新政策选择

第二节  完善供给端创新支持政策
一、政府要增加科技研发投入，并强化其带动效应
二、增加税收优惠
三、促进企业创新的投融资环境完善
四、支持创新平台建设
五、强化产学研合作政策
六、知识产权政策要立足于提高运用知识产权的能力
七、创新人才政策
八、科技、产业和创新系统化政策

第三节  完善创新需求鼓励政策
一、政府资金投向主要由研发补贴转向启动市场
二、政府采购重点支持本土企业技术创新
三、鼓励社会非营利机构设立科技奖励基金

第四节  强化自主创新支持政策的执行力度
一、加强政策落地的执行力度
二、加强政策后评估研究
三、推进政策“普惠”机制
附：上海市政府和人大出台的有关鼓励自主创新的政策与地方法规

第九章  长三角自主创新的体制、环境和政策研究
第一节  长三角区域创新能力的现状分析
一、长三角已具备自主创新的基础和内在动力
二、长三角自主创新能力在全国居领先地位

第二节  影响长三角创新能力的关键因素在于缺乏制度创新
一、长三角地区自主创新缺乏有效合作
二、影响区域创新体系的因素分析

第三节  提升长三角创新能力的对策建议
一、明确长三角创新体系建设的目标规划
二、共同优化科技创新合作的市场环境
三、营造促进自主创新的区域政策环境
四、实现分工协作与周边省份的融合开放环境
五、以产业集群为依托构筑创新性空间
六、协同建设长三角科技创新公共服务平台
七、围绕重大关键技术开展联合攻关
八、构建长三角人才资源配置和共享机制
九、塑造以创业、创新、创造为核心的长三角区域文化

第十章  各国政府鼓励创新的政策措施与案例介绍
第一节  各国政府鼓励本国企业技术创新政策
一、财税政策
二、政府采购
三、知识产权保护政策
四、人才政策
五、激励中小企业技术创新政策

第二节  世界若干创新国家与城市案例介绍
一、韩国——国家创新体系的典型
二、新加坡——制度创新的典范
三、大阪——中小企业之都
四、波士顿——信息时代创新城市的典范
五、赫尔辛基——文化创新之都
后记