1.从《内经》性味埕论阐述药性：肉桂，味甘、辛.气香，性温，入足厥阴肝经。《玉楸药解》分析肉桂有温肝暖血，破瘀消瘕功能，是因为“金之味辛，木之味酸，……金之性收，木之性散，……香甘人土，辛甘入木，辛香之气，善行滞结，是以最解肝脾之郁。”“辛则肺病，酸则肝病，以其郁也，故肺宜酸收而肝宜辛散。肺得酸收，则革者从降而辛味收，肝得辛散，则曲者直升而酸味散矣，事有相反而相成者，此类是也。肝脾发舒，温气升达，而化阳神，阳神司令，阴邪无权，却病延年之道，不外乎此。”
2.从贵阳贱阴气化学说阐述药性：黄氏认为“人知气之为阳，而不知其实含阴精.知血之为阴，而不知其实抱阳气。……阳复则生，阴胜则死，生之与死，美恶不同.阳之与阴，贵贱自殊。”若温气衰弱则阴盛，或温气抑郁而生风燥，种种诸病，总不出此。《玉楸药解》称肉桂重厚内行，直达脏腑，本系树皮，亦主走表中之里，温暖条畅，大补血中温气，扶阳暖肝，故凡经络堙瘀，腰腿湿寒，关节闭塞，脏腑瘢结，腹胁疼痛，心痛，上下脱泄，九窍不守，紫黑成块，腐败不鲜，女子月期产后等证，无非温气微弱，血分寒冱之故，悉宜肉桂培其根本，余药不能。黄氏痛斥“下士庸工，不解阴阳之贵贱，千古祸源，积成于贵阴贱阳之家矣。”因此《玉楸药解》对寒凉、滋腻、香燥药物多有微词。如马兜铃苦寒“多用则吐”， “龟地之杀人多”，木香性燥而“庸工以治肝家之病”，枸杞子苦寒，“服之必生溏泄，《本草》谓其助阳，甚不然也”。
3.从脾胃中气升降学说阐述药理：黄氏认为脾胃中气为阴阳升降之枢纽，清气左旋升而化火，浊气右转降而化水，木之气温而升，金之气凉而降，水火金木四象为中气之变化。
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