邱宗荫，1941年生，重庆市首届学术技术带头人（药学）。社会兼职有国务院学位委员会学科评议组成员，中国药学会理事，中国色谱学会理事，全国高校实验室研究会常务理事，重庆市科技顾问团成员、重庆市大型科学仪器及设施资源共享专家组组长，重庆药学会理事长，重庆色谱学会理事长，重庆市执业药师培训中心副主任，重庆生物技术协会副理事长，日本政府贷款《重庆市高等教育项目》专家组长等。2005年被授予“重庆市先进工作者”称号。
    尹一兵，男，教授，博士生导师，重庆人。1982年毕业于重庆医科大学医疗系，1989年获医学硕士学位（临床检验诊断学）。1991-1994年美国Rockefeller大学分子传染病实验室副研究员，现任重庆医科大学医学检验系主任（本专业唯一的国家重点学科），临床检验诊断学实验室主任（教育部重点实验室，重庆市市级重点实验室）。重庆市临床检验诊断学学术技术带头人。

    《临床蛋白质组学》详细阐述了临床蛋白质组学研究所必需的基本理论与策略，系统、全面、深入浅出地介绍了蛋白质组学在临床医学与药学领域中的应用及发展状况。全书分为15章，一～四章介绍临床蛋白质组学研究的基本理论与策略，蛋白质组分析的基础技术，液相色谱技术在蛋白质组分析中的应用．以及基于稳定同位素标记的定量蛋白质组学分析技术。五～十五章重点介绍蛋白质组学在临床医学领域中的应用及其最新进展，包括临床蛋白质组分析中的样品制备、MALDI-TOF-MS在临床蛋白质组学研究中的应用、血浆／血清蛋白质组学、血细胞蛋白质组学、唾液蛋白质组学、精液蛋白质组学、肿瘤蛋白质组学、疾病蛋白质组学、临床干细胞蛋白质组学、药物蛋白质组学及其临床应用等。
    《临床蛋白质组学》既是初学者开展临床蛋白质组学研究工作的入门向导，也可为从事医学、药学、蛋白质组学、生物化学、细胞生物学、分子生物学、分析化学和相关领域研究的人员提供参考，可用作高等院校相关专业本科高年级学生和研究生的教学参考书或教材。

    第二章  蛋白质组分析的基础技术
    双向电泳（two dimensional electrophresis，2-DE）是当前蛋白质组学研究中分辨率最高、信息量最大的分离技术。在比较蛋白质组学研究中，双向电泳还是不可缺少的手段。目前所应用的二维电泳体系是由0’Farrell等于l957年发明的，其原理是根据蛋白质的两个一级属性（等电点和分子质量），将一种蛋白质样品进行两次电泳，即：在第一个方向上按等电点高低进行分离，称为等电聚焦；在第二个方向（与第一次电泳成直角的方向）上按分子质量大小进行分离。
    根据第一向等电聚焦条件和方式的不同，可将双向电泳分为三种系统：①ISO-DALT（isoelectric focusing followed by separation with respect to molecular mass expressed in dal—tons）系统。电泳在聚丙烯酰胺管胶中进行，载体两性电解质（carrier ampholytes）在外加
    电场作用下形成pH梯度。该系统的缺点是pH梯度不稳定（如阴极漂移）、重复性差、上样量低，故不利于不同实验室之间进行图谱的比较和数据发布；②IPG—DALT系统。使用固相pH梯度（immobilized pH gradient，IPG）胶的等电聚焦系统。其pH梯度的形成依赖于不同pK的一类合成的化合物。这是目前蛋白质组学研究中用得最多的双向电泳体系；③非平衡pH梯度电泳（non—equilibrium pH gradient electrophoresis，NEPHGE）系统。蛋白质样品被加在pH 7～10或pH 3.5～l0的凝胶的酸性部分进行分离，电泳时间相对比较短。NEPHGE旨在克服平衡pH梯度电泳时的严重阴极漂移和碱性蛋白的丢失，但重复性比较差。
    此外，第一相不采用等电聚焦方式的双向电泳有BN／SDS.PAGE双向电泳、对角线双向电泳等。
     2.1.1  IPG-DALT双向电泳
    2.1.1.1  IPG—DAl.T双向电泳的流程
    IPG.DALT双向电泳的流程如图2.1所示。图中，A为使用IPG胶的等电聚焦过程，被分离的样品加在重泡胀的固相pH梯度胶条（immobilized pH gradient trip）上，通电后，样品中的蛋白质成分按照各自的等电点聚集在胶条上不同的pH梯度区，形成了不同的谱带，每个谱带中聚集了等电点相近的蛋白质成分。8为SDS.PAGE电泳的过程。第一向等电聚焦后的胶条在SDS和DTT中平衡后，贴在SDS.PAGE胶板的负极端进行电泳。

第一章 绪论
第一节 蛋白质组学的概念及其发展史
一、蛋白质组学的概念
二、蛋白质组学的产生与发展

第二节 蛋白质组学研究方法概述
一、蛋白质组研究中的样品制备
二、蛋白质组研究中的样品分离
三、蛋白质组研究中的样品分析鉴定
四、蛋白质组研究的新技术
五、蛋白质组学研究的生物信息学

第三节 蛋白质组学在疾病研究中的应用
参考文献

第二章 蛋白质样品制备技术
第一节 蛋白质制备的基本方法
一、细胞的破碎裂解
二、制备蛋白质样品常用的缓冲液
三、离液剂、还原剂、表面活性剂及蛋白酶抑制剂的选择
四、蛋白质的沉淀与浓缩
五、蛋白质的定量
六、样品污染物的去除

第二节 细胞蛋白质的制备
一、蛋白质一步提取法
二、蛋白质分步顺序提取法
三、亚细胞器蛋白质的分别提取

第三节 体液蛋白质的制备
一、血浆和血清双向凝胶电泳蛋白质样品的制备
二、脑脊液双向凝胶电泳蛋白质样品的制备
三、尿液双向凝胶电泳蛋白质样品的制备
参考文献

第三章 蛋白质双向凝胶电泳分离技术
第一节 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术的发展
一、固相pH梯度等电聚焦双向电泳技术的发展
二、其他类型的双向凝胶电泳技术
三、亚蛋白质组阵列重叠群技术

第二节 蛋白质双向凝胶电泳分析的原理
第三节 双向凝胶电泳实验操作方法
一、传统IEF方法（ISODALT电泳）
二、固相pH梯度SDS双向凝胶电泳（IPGDALT）方法

第四节 双向凝胶电泳图像分析
一、双向凝胶电泳数字化图像的获取
二、双向凝胶电泳图像分析

第五节 双向凝胶电泳数据库的构建
参考文献

第四章 蛋白质组学研究中的非胶技术
第一节 液相色谱法
一、液相色谱法概述
二、高效液相色谱法
三、高效液相色谱装置
四、多维液相色谱法

第二节 毛细管电泳
一、毛细管区带电泳
二、毛细管胶束电动色谱
三、毛细管等电聚焦电泳
四、毛细管筛分电泳

第三节 非凝胶技术与质谱联用在蛋白质组学研究中的应用
一、二维离线式制备型高效液相色谱
二、一维液相色谱与质谱联用
三、多维液相色谱与质谱联用
四、液相色谱毛细管电泳与质谱联用
参考文献

第五章 质谱技术与蛋白质鉴定
第一节 蛋白质鉴定技术概述
一、质谱技术
二、质谱技术鉴定蛋白质策略

第二节 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术
一、基质辅助激光解析电离技术
二、飞行时间质谱
三、肽质量指纹谱鉴定蛋白质技术

第三节 电喷雾串联质谱技术
一、电喷雾电离质谱的原理和特点
二、电喷雾质谱法测定蛋白质和多肽分子量
三、电喷雾串联质谱法分析多肽和蛋白质的一级结构
四、电喷雾串联质谱数据库检索法鉴定蛋白质

第四节 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术
一、表面增强激光解析离子化飞行时间质谱蛋白质芯片系统组成及原理
二、表面增强激光解析离子化飞行时间质谱分析步骤
三、表面增强激光解析离子化飞行时间质谱的应用
参考文献

第六章 定量蛋白质组学研究技术
第一节 基于双向凝胶电泳的定量蛋白质组研究策略
一、荧光差示双向电泳的实验原理
二、荧光差示双向电泳实例及实验过程
三、注意事项及存在的问题

第二节 基于生物质谱的定量蛋白质组研究策略
一、体内标记
二、体外标记
三、需要注意的问题
参考文献

第七章 蛋白质组翻译后修饰分析策略
第一节 概述
第二节 磷酸化蛋白质组研究
一、概况
二、磷酸化蛋白质的检测方法
三、磷酸化蛋白质或多肽的分离和富集
四、磷酸化肽段的质谱检测
五、磷酸化位点的质谱分析
六、磷酸化蛋白质组的定量分析
七、蛋白质磷酸化的动力学研究

第三节 糖基化蛋白质组研究
一、概况
二、糖基化蛋白的结构与类型
三、蛋白质糖基化总体分析流程
四、糖基化蛋白质的分离技术
五、生物质谱技术解析蛋白质糖基化
六、各类型糖基化蛋白质组分析策略
参考文献

第八章 功能蛋白质组学研究技术
第一节 蛋白质相互作用研究技术
一、酵母双杂交系统
二、噬菌体表面显示技术
三、基于质谱的蛋白质相互作用研究方法

第二节 蛋白质芯片技术
一、蛋白质芯片种类
二、蛋白质芯片探针的制备
三、蛋白质芯片的检测
四、蛋白质芯片技术的应用

第三节 磷酸化蛋白质组分析技术在信号传导研究中的应用
一、基于凝胶电泳的磷酸化蛋白质组分析技术
二、非凝胶电泳的磷酸化蛋白质组分析技术
参考文献

第九章 蛋白质组研究中的生物信息学
……
第十章 临床蛋白质组学研究
第十一章 实体肿瘤的蛋白质组学研究
第十二章 血液系统疾病的蛋白质组研究
第十四章 心血管疾病蛋白组学
第十五章 传染病的蛋白质组学研究
第十六章 衰老蛋白质组学研究
附录SWISSPROT中DPAGE数据库