由于杰伊曾表示自己无力承担招待外国使节、军事将领以及大陆会议其他成员的费用，所以，他当选后的第二天，大陆会议就专门成立一个委员会讨论主席的补助问题。最后，大陆会议通过决议，决定用公共资金给主席租用便利的住所，并提供桌子、马车和仆人。不久，杰伊便雇了一个管家，租了一套房子，使自己能用与身份相称的方式招待各方宾客。 在内政方面，大陆券贬值是杰伊任大陆会议主席期间面临的一个大问题。由于大陆会议没有征税权，因此，筹措战争费用便成了最让人头疼的事。在著名的邦克山战斗后不久，为解燃眉之急，大陆会议于1775年6月决定发行全国通用的信用券，即大陆券。然而，自1778年开始，大陆券迅速贬值。华盛顿在1779年4月给杰伊的信中埋怨道：“一车的钱几乎买不到一车的给养。”大陆券的急剧贬值一方面应归咎于各州，另一方面则应归咎于大陆会议自身，因为，为支付日益增加的战争开支，大陆会议不得不大量增发大陆券。很显然，增发大陆券毕竟不是解决问题的办法，所以，在杰伊到任后的半年中，大陆会议便两次向各州征缴货币。但这些努力并没能阻止大陆券的继续贬值。1779年9月，大陆会议作出决议，当大陆券达到两亿元时便停止发行。也就是说，以后大陆会议需要开发新的途径来支付战争费用。为使自己的做法得到支持，大陆会议决定发表一封致全美人民的公开信。通常情况下，主席不会担任起草的工作，但大陆会议此次却将起草这封信的任务交给了杰伊。杰伊不负重托，完成了这个工作。大陆会议采纳了杰伊的长信，并以英语和德语两个版本刊印发行。 在信中，杰伊首先说明大陆会议最初发行大陆券的必要性，接着便详细解释大陆券贬值的原因。他指出，大陆券贬值部分是客观原因造成的，即大陆券的大量增发；但更主要的原因是人为的，即人们对美国是否能够成为独立国家并偿还债务没有信心。杰伊随即以大量篇幅论证美国独立的必然性和偿还债务的可能行，以消除人们的顾虑。最后，他请求各州及人民通过贷款和纳税的方式为独立战争提供资金。他恳切地说，纳税是“为你们自己及你们子孙后代的自由、和平与安全所应付的代价”。
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