海河流域要针对水资源短缺、河湖萎缩、污染严重、地下水超采、防洪保障能力不足等问题，以水生态环境保护与修复为核心，科学配置当地水、外调水和非常规水源，有效限采地下水，全面推进节水型社会建设，建成完善的水利工程体系，保障供水安全，修复流域生态，改善河库水质，提升防洪能力，从根本上把海河治好，为首都和环渤海经济圈发展提供支撑和保障。
珠江流域要针对水旱灾害频繁、调控能力不足、河口咸潮上溯、局部水质恶化等问题，统筹流域治理开发与保护，加快控制性枢纽建设，强化水资源统一管理和枯水期水量调度，加大节水治污力度，加强珠江三角洲和高原湖泊生态保护，有效防治石漠化，促进水土资源可持续利用，提高防洪能力，保障供水安全，改善河流水质，维系河网畅通，建设绿色珠江。
松花江辽河流域要针对水资源分布不均、水质污染、水土流失、湿地萎缩等问题，构建“东水中引、北水南调”的水资源配置格局，推进以三江平原、松嫩平原为重点的灌区建设，提高重点城市和地区的防洪能力，加强水资源和重要湿地保护，加快黑土区水土流失综合治理，实现城乡防洪安全、供水能力提高、资源配置合理、生态环境优良，为东北老工业基地振兴、国家粮食核心产区和后备产区建设提供强有力的水利支撑。
太湖流域要针对经济发达、河网密布、开发程度高、环境压力和风暴潮威胁大等特点，以流域水环境综合治理为重点，加快建成引得进、蓄得住、排得出、可调控的现代化管理调度体系，完善协调机制，强化依法管理，提高防洪防台能力，保障城乡供水安全，搞好节水调水治污，改善流域生态环境，为加快太湖流域现代化建设提供水利保障。
第四，不断优化区域水利发展布局。各地区要围绕区域发展总体战略目标，适应西部大开发、中部崛起、东部率先发展、东北老工业基地振兴的要求，根据水利实际，因地制宜，突出发展重点，优化发展格局，推动区域水利协调发展。
东部沿海地区要适应“两个率先”的要求，抓住产业结构优化升级加速推进、现代产业体系加快发展的战略机遇，协调好水资源供用耗排的关系，加快现代水利工程体系和管理体系建设，提高防洪防潮防台防涝和山洪灾害防治能力，加快推进节水防污型社会建设，提高城乡供水保障能力，抓好排污控制和污水处理及再生利用，保护河湖水域及河口尾闾良好的经济功能和生态系统，提高水资源和水环境承载能力。
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