湖泊网围养殖发展至今只有二十多年的历史，关于网围养殖方面的系统研究并不十分充分，许多的问题还有待进一步深入和开展。但初步的研究测算表明，湖泊网围养殖如不加控制地过度发展，尤其是采用大量外源性饲料的投入养殖模式造成的自身污染给环境水质的下降和富营养化的发展带来了一定的负面影响，已有初步的测算证明。然而经生产实践证明，网围生态养殖模式的推广和应用对湖泊水域环境还是有一定良好作用，这在于通过鱼、蟹类的活动，水的中介，可促进湖泊中处于静态的水草和土壤肥力加速进入物质循环流动和转化；鱼蟹吃食水草、螺蚬人工割等使水草生产量倍增，提供水草生长的土壤肥力转化加速，利用水草、螺觑具有一定的净化水质的作用，同时还可以作为养殖对象的饵料这种功能，最后将草、螺蚬等转化成优质水产品。因此对湖泊养殖渔业结构进行调整，充分合理利用湖泊天然饵料生物资源，实现湖泊养殖渔业生态效益与经济效益的动态平衡，关键是网围养殖的发展决不应超过环境自我净化的能力。目前江苏省重点湖泊的网围养殖渔业已初步形成湖泊生态渔业的雏形。其通过调整养殖模式、养殖结构、养殖对象，合理开发利用了天然生物资源，在网围轮休区、退养区开展生物多样性恢复重建，大力推广轮牧式网围养殖，有效降低了商品饵料的投喂量，达到既合理利用湖泊天然生物饵料，又减少外源性营养物质的目的。这是新时期我国湖泊渔业增养殖发展之必然。因此在现阶段关于网围养殖基础研究还没有完全搞清楚的情况下，湖泊网围养殖应根据湖泊天然生物资源的分布状况、分布区域、可利用资源量、种类组成等情况综合考虑，适度应用湖泊水域，以保持水域环境的良性循环。
江苏各重点湖泊合理网围养殖面积的测算是根据各湖泊天然生物资源的状况，尤其是湖泊中的水生植物生物量和底栖动物螺类生物量的情况估算而成。尽管这种算法还缺乏足够的科学依据，但应该承认在目前阶段这种方法有其一定的道理和依据，而且通过生产实践的应用发现对水域环境的保护和避免渔业自身污染还是有一定的效果和作用的。江苏各湖泊现在应用的养殖模式总体上可分为两大类，网围养鱼和网围养蟹。从实际效果来分析，如果是大量的依靠外源性饲料的投入，应该说对养殖环境是有一定的影响和负面作用的。但现在各重点湖泊普遍应用了轮牧式网围养殖方式，这种模式充分利用了水生植物和底栖动物资源，同时搭配了一定比例的滤食性鱼类，利用了湖泊水体中的浮游动物和浮游植物资源，大幅度降低了外源性饲料的投入量，单位水体的有效渔获量得到控制，达到了比较合理的水平。
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