学科竞赛和创新竞赛成绩优异。仅统计1999-2009年，获得省以上一等奖和特等奖的就有583人次。其中突出的有：在国际中学生信息学奥林匹克竞赛中，林希德继李申杰、章准平荣获三金后又获银质奖章；王珂编写出价值百万的“分布式虚拟现实系统”计算机程序；华演发明的“记忆合金全自动保护安全煤气灶”荣获英特尔国际科学工程大赛一等奖，国际小行星中心用他的名字命名一颗小行星为“华演星”；周辰研制的“眼球鼠标”荣获江苏省青少年科技创新大赛一等奖；王冉发明的“双区域液晶显示系统”荣获全国“明天小小科学家”大赛一等奖；严梦媛等荣获中国女子数学奥林匹克2枚金牌、3枚银牌。近三年来，我校机器人工作室的学生参加国内外机器人大奖赛，仅获一等奖就有19次。我校模拟联合国社团在数以十计的重大活动中，学生个人和学校屡次获得各种奖项。费滢滢和叶子两位女生参加全球华人美文大赛荣获一等奖，她们的得奖作品被编入全国高三阅读教材；林晨17岁就获得“国际象棋大师”称号。女子篮球队先后荣获全省、全国乃至亚洲中学生竞赛冠军。
金陵中学以她突出的改革创新成果被评为江苏省重点中学、模范学校、国家级示范高中、四星级高中、德育先进校、优秀体育传统学校、全国群众体育先进集体、全国青少年群众体育先进集体，而且成为江苏省青少年科技教育创新基地、江苏省青少年科技教育特色学校、江苏省物理教学实验基地、南京大学与金陵中学理科创新教育基地、南京市科技特色学校和机器人特色学校等。
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