从1991年到2006年，随着议会制政府的复辟，为宗教政党巩固他们在国家政权中的地位进一步打开缺口。原教旨主义者和狂热分子让整个国家都感受到他们可怕的存在，特别是2000年至2005年间。国家安全由于狂热分子的公然袭击而一度处于险境。
伊斯兰教并不允许伤及无辜，但这些所谓的“伊斯兰的”原教旨主义者却通过曲解伊斯兰教的神启、并以它的名义杀死许多无辜的人。他们公开宣称自己无视和厌恶国家体系，包括司法体系，并宣布他们将把这些根据他们的说法不符合《古兰经》信条的东西统统地夷为平地。的确，法院成为他们袭击的首当其冲目标，两名法官在他们上班的途中被“夷为平地”了。有一些记者也因为发表了一些关于他们（狂热分子）行动的“诽谤性的”报道而遭到同样待遇。2005年8月17号作为这个国家历史上黑暗的一天而将被记住，因为在这一天，这些极端分子在所有的地区总部的脆弱区域（包括首都）实施了一系列自杀式炸弹袭击。在他们的政治领袖（可以说他们在当时的政府中占着重要位置）祝福之下，这些宗教偏执分子为了建立“上帝的治理”准备好去做任何事。他们拒绝允许任何除他们之外的信仰和信条的存在。
在原教旨主义势力兴起的背景之下，相互仇视的执政党和反对党的关系在2006年恶化到使国家机器几近崩溃，在强大的军队命令之下，国家总统于2007年1月11日宣布处于紧急状态，以“恢复法律和秩序”。计划于2006年举行的大选最终于2008年12月举行。原教旨主义政党与从2001年至2006年执政的政党--孟加拉国民党（BNP）结成了同盟。尽管如此，与艾尔沙德领导的孟加拉民族党以及其他一些左翼政治党派争夺选票的孟加拉人民联盟却取得了压倒性的胜利，政治分析家们把此看做是这个国家民意对发展中的原教旨主义的反抗。
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