乾隆二十四年（1759），清廷统一全疆时，所统计的回部人口约26万余人。准部人口在极盛时曾有众20余万户，60余万口。据魏源《圣武记》记载：清军平准时，“料数十万户中，先痘死者十之四，继窜入俄罗斯哈萨克者十之二，卒歼于大兵者十之三”。照此说法，人口存者仅六七万人。以后由于驻军和内地移民屯垦，新疆人口有所增加。1820年前后，统计的民户已达9万余户，47万余口。另有记载表明，伊犁将军直接统辖的兵员及其眷属已达9.8万人，其他地区驻军约1.2万人。若再加上大量未经统计的各族人口，总人口大约在100万人以上，已超过准部极盛时该地区的人口规模。
内地向甘肃西部及新疆地区的移民运动，大约始于康熙末到雍正年间，主要是清政府所发动的为军事服务的屯垦移民。康熙五十五年（1716），尚书富宁安等勘明哈密所属布营鲁儿、图古里克接壤之处，并巴里坤、都尔博勒金、喀喇乌苏，及西吉木、达里图、布隆吉尔附近之上浦、下浦等处“俱可耕种”。清廷当即下令准备口粮、牛种等予以耕种，兵丁有愿耕种者亦令耕种，“俟收成后，以米数奏请议叙”。雍正元年（1723），由于布隆吉尔驻军俸饷由内地转输，多所不便，清廷又下令：“于每营拨余丁二百，每相官给牛二头、籽种四石、口粮三石；次年给半；三年但给籽种之半；嗣后勿给。其由即为耕者恒产。无论米、麦、青稞，计收三石，以为兵丁月饷。”这是军屯的开始。
第二年，清廷令直隶、山西、河南、山东、陕西五省，连家口发遣的军流人犯，往西宁开垦。雍正七年（1729），又招募民人开垦安西、沙州等处。雍正十一年（1733），安西的上浦、下浦已分立五堡，安置回民2337户，9264人。
军事行动的本身，更直接吸引了大批流动人口。据记载，雍正末年在肃州一带，“运粮车夫、采割草束夫役，俱系陕甘无业贫民，流寓佣作，以为度日之计，不下万人”。
乾隆七年（1742）甘肃巡抚黄廷桂疏称：“甘肃地处边徼，从前土旷人稀。我朝定鼎以来，流亡渐集。”到乾隆中期，该省的统计人口已超过陕西。
乾隆中期，天山北、南两路次第平定，新疆地区的移民也开始逐渐增多。
原住黑龙江地区的索伦兵（达斡尔、鄂温克）长于骑射，骁勇善战，有数千粗壮男子被轮番征调参与平准之役。乾隆二十七年（1762），因不堪频繁换防跋涉之苦，乃请求携眷定居新疆，第二年获得批准。西迁的男女老幼2000余人经过整整两年的长途跋涉，方于乾隆三十年（1765）到达伊犁。原驻防盛京地区的锡伯官兵及其家属汁4000余人于乾隆二十九年（1764）春自盛京出发，途径乌里雅苏台等地，亦于乾隆三十年进入新疆塔城地区，不久又移驻伊犁河南岸。
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