产业生态子系统归根结底是产业经济子系统的一种高级阶段，而产业经济子系统的根本和存在基础就是产业价值链，产业经济系统正是在市场价格信号的引导下而形成的。可以这样认为，产业生态子系统的良性演化以及与其他生态子系统的耦合也必须建立在价值链的生态方向转化的基础之上，只有当产业生态子系统中流动的物质，在其生态价值和经济价值上达到统一的时候，产业生态子系统和产业复合生态系统才有可能存在，因此，如何促使生态链和价值链的有效统一，是产业复合生态系统存在和发展的关键。
科技因素是一种特殊的信息流，是人力资本累积的一种形式，也是产业复合生态系统中自然、经济和社会发展的另一个重要的推动因素。科学技术的发展使人类对自然、经济和社会系统存在和发展规律的认识不断深化，从而保证了人类的生存和发展。特别是从科技革命爆发以来，科学技术对世界发展的影响有目共睹。然而，以往的科技，由于忽视了产业复合生态系统中各子系统之间的联系，将各子系统的发展孤立起来，从而给自然生态系统带来了巨大的损害。换个角度来看，这其实也是科学技术发展的有限性造成的，要解决这个问题，还必须依靠科学技术的进一步发展，深化人类对系统整体的认知和把握，从而促进产业复合生态系统向着稳定和良性的方向演化。
社会制度因素是人为影响和调控产业复合生态系统的一个重要手段。它包括正式制度和非正式制度两种类型。正式制度指的是人们有意识地建立并由一定社会强制力保证执行的具有强制性的规则，例如法律、法令、条例等，而非正式制度则指的是人们长期建立、约定俗成的社会习俗、文化传统、意识形态、伦理道德和价值观念等。它通过成文规则或一种社会公认的契约形式维持社会特定的经济和社会形态、功能和运行，从系统的观点来看，也就是维持系统的某种整体功能和效益。社会制度因素对产业复合生态系统或其组成部门施加着直接或者间接的影响。
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