《温病条辨析评》分为五卷：首卷历引经文为纲，分注为目，原温病之始；二卷为上焦篇，凡一切温病之属上焦者系之；三卷为中焦篇，凡温病之属中焦者系之；四卷为下焦篇，凡温病之属下焦者系之；五卷杂说、救逆、病后调治，俾阅者心目了然，胸有成局，不致临证混淆，有治上犯中、治中犯下之弊。 《温病条辨析评》系统地、完整地、有创见地论述了温病的辨证论治规律，创立了三焦辨证学说，为空前所仅有，汇集温病学之大成，现已列为大学学习中医温病学的教材之一。

问心堂温病条辨原病篇
卷一  上焦篇
提要
风温  温热  温疫  温毒  冬温
暑温
伏暑
湿温  寒湿
温疟
秋燥
补秋燥胜气论
附  证治分类选
（一）温热证类
（二）湿热证类

卷二  中焦篇
提要
风温  温热  温疫  温毒  冬温
暑温伏暑
寒湿
湿温
秋燥
附  证治分类
（一）温热证类
（二）湿热证类

卷三  下焦篇
提要
风温  温热  温疫  温毒  冬温
暑温伏暑
寒湿
湿温
秋燥
附  证治分类选
（一）温热证类
（二）湿热证类

卷四  杂说
汗论
方中行先生或问六气论
伤寒注论
风论
医书亦有经子史集论
本论起银翘散论
本论粗具规模论
寒疫论
伪病名论
温病起手太阴论
燥气论
外感总数论
治病法论
吴又可温病禁黄连论
风温、温热气复论
治血论
九窍论
形体论

卷五  解产难
解产难题词
产后总论
产后三大证论一
产后三大证论二
产后三大证论三
产后瘀血论
产后宜补宜泻论
产后六气为病论
产后不可用白芍辨
产后误用归芎亦能致瘛论
产后当究奇经论
下死胎不可拘执论
催生不可拘执论
产后当补心气论
产后虚寒虚热分别论治论
保胎论一
保胎论二

卷六  解儿难
解儿难题词
儿科总论
俗传儿科为纯阳辨
儿科用药论
儿科风药禁
痉因质疑
湿痉或问
痉有寒热虚实四大纲论
小儿痉病瘛病共有九大纲论
小儿易痉总论
痉病瘛病总论
六气当汗不当汗论
疳疾论
痘证总论
痘证禁表药论
痘证初起用药论
治痘明家论
痘疮稀少不可恃论
痘证限期论
行浆务令满足论
疹论
泻白散不可妄用论
万物各有偏胜论
草木各得一太极论