本书涵盖了微生物生态学基本内容，主要包括微生物生态学基本原理，自然界微生物种类及其多样性，极端微生物类型及开发意义，微生物种群相互作用，微生物群落发展与演替，微生物与生物地球化学循环，环境因子对微生物的影响，微生物与动植物间的相互关系，微生物分子生态学，微生物生态学研究方法、技术及其应用，还介绍了微生态学与微生态制剂等，尤其是极端环境中的太空微生物和微生物分子生态学与研究技术以及基因芯片技术等最新前沿知识。
　　本书取材新颖，编排合理，结构紧凑，内容丰富而精练。可作为生命科学、生物技术专业及农林、畜牧、医学等领域研究生的教科书，是硕士生方向必修课和博士生选修课的教材，还可以作为从事微生物生态学研究人员的参考用书。

　　第一章　生态学与微生物生态学
　　第一节　生态学
　　一、生态学定义
　　地球上的一切生物都是在极其复杂的条件下，经历了漫长的地质变迁、气候变化、冰川袭击和生物之间的竞争等无数次考验才幸存下来的。它们的形态、生理、行为的特点都是与它们生存的特定环境相适应的，它们同周围的环境相互联系、相互依存、相互协调，通过繁衍后代，得以生存和发展。
　　生态学（ecology）就是研究生物与其周围的生物与非生物环境之间相互作用规律的科学。这里所指的周围环境有两个明显区别的部分，即无机环境和有机环境。无机环境是指温度、光、水分、空气及土壤等的物理和化学因素。有机环境是指来自其他生物的任何影响，如竞争、捕食、寄生和共生等。这就是说，生物的生存、活动不仅受环境中无机因素的影响，而且和环境中的其他生物有着密切的关系，即生物之间彼此互为环境条件。生物与环境之间的相互关系不仅表现在生物受环境的影响，而且生物通过自己的生命活动，可以影响甚至改变周围的环境，表现出动态平衡的关系。生态学是生物科学的一个重要分支与基础学科之一。
　　生态学一词，由希腊文“oikos”和“logos”两个词的词根组成，前者意为“居住地”或“住所”，后者是指“研究”或“科学”，从字面上来看，生态学意为生物的科学。最早（1869）使用这个词的是德国生物学家海克尔（E.Haeckel）。
　　后来许多学者对生态学也作过各种解释，可以说是众说纷纭，但一般可归纳如下：
　　①生态学是研究包括人类在内的生物与环境相互作用规律的科学。
　　②生态学是研究生物与生物以及生物与自然环境相互作用及其动态规律的科学。
　　③生态学是研究人类活动与社会环境和自然环境之间相互作用规律的科学。

第一章 生态学与微生物生态学
第一节 生态学
一、生态学定义
二、生态学研究内容
三、生态学分类
四、生态学的发展

第二节 微生物生态学
一、微生物生态学的定义
二、微生物生态学的研究范围
三、微生物生态学的任务
四、微生物生态学的发展
五、微生物生态学与其他学科的关系

第二章 微生物生态学的基本原理
第一节 环境与微环境
一、环境
二、生境
三、生态位
四、微环境
五、表面环境

第二节 生物圈和生态系统
一、生物圈
二、生态系统
三、微生物生态系统

第三节 生态系统的功能
一、物种流
二、能量流
三、食物链
四、营养级
五、信息流

第三章 自然界中的微生物及其多样性
第一节 微生物在土壤中的分布
一、土壤的形成
二、土壤的环境条件
三、土壤中微生物的生态分布

第二节 微生物在水体中的分布
一、清水型与腐败型水生微生物
二、淡水微生物和海水微生物
三、水中微生物的作用
四、水中的微生物与饮用水
第三节 微生物在大气中的分布

第四节 工农业产品中的微生物
一、粮食和食品中的微生物
二、肉类上的微生物
三、鱼类上的微生物
四、乳制品中的微生物
五、工业材料及其制品中的微生物
第五节 生物圈中的第四大生命域

第四章 极端环境中的微生物
第一节 嗜热微生物和嗜冷微生物
一、嗜热微生物
二、嗜冷微生物

第二节 嗜酸微生物和嗜碱微生物
一、嗜酸微生物
二、嗜碱微生物

第三节 其他嗜极微生物
一、嗜盐微生物
二、嗜压微生物
三、抗辐射微生物
四、太空微生物
第四节 嗜极微生物的开发利用

第五章 微生物种群增长与相互作用
第一节 种群的基本概念
一、种群的定义
二、种群密度
三、种群相互作用

第二节 种群增长
一、微生物在封闭环境内的增长
二、微生物在开放环境内的增长

第三节 种群之间的相互作用
一、相互作用的基本类型
二、种群之间竞争的动力学原理

第六章 微生物群落发展与演替
第一节 群落的基本概念
一、群落定义
二、群落形成

第二节 群落的主要特征
一、种多样性
二、垂直结构
三、优势种
四、群落生境

第三节 群落的发展和演替
一、微生物种群的适应作用和自然选择
二、微生物群落的发展
三、微生物群落的演替

第七章 微生物与生物地球化学循环
第一节 有机物的微生物降解
一、微生物在生态系统中的作用
二、有机物降解的重要性

第二节碳素循环
一、含碳化合物的主要来源
二、碳在食物网中的转移
三、生境中的碳循环
四、自然多聚物的微生物降解
五、微生物与全球性的碳循环

第三节 氮素循环
一、硝化作用
二、硝酸还原作用和反硝化作用
三、固氮作用
四、环境和农业活动对氮素循环的影响

第四节 其他元素的循环
一、氧循环
二、氢循环
三、硫循环
四、磷循环
五、铁循环
六、硅循环

第八章 环境因子对微生物的影响
第一节 营养因子对微生物的影响
一、最小量定律
二、营养因子及其生理作用

第二节 物理因子对微生物的影响
一、温度
二、水分活度
三、渗透压
四、辐射
五、超声波
六、微波
七、压力

第三节 化学因子对微生物的影响
——、pH
二、Eh
三、化学物质

第九章 微生物与动植物的相互关系
第一节 微生物与植物之间的相互关系
一、植物表面微生物
二、植物与微生物的共生体
三、微生物引起的植物病害

第二节 微生物与动物之间的相互关系
一、微生物与昆虫的共生
二、瘤胃共生
三、发光细菌和海洋鱼类的共生
四、光合微生物与无脊椎动物的共生
五、动物与微生物的捕食关系
六、动物致病的某些生态学问题

第三节 微生物与人体之间的相互关系
一、微生物与皮肤健康
二、微生物与口腔健康
三、微生物与胃肠道健康

第十章 微生物生态学研究的方法和技术
第一节 经典方法和技术
一、样品的采集、富集培养和微生物的纯培养的分离
二、显微计数法和荧光染色直接计数法
三、最大近似值法
四、活菌计数法

第二节 生理生化方法
一、Biolog微平板法
二、PLFA谱图分析

第三节 分子生物学方法
一、(G+c)摩尔百分含量
二、核酸探针杂交技术
三、DNA—DNA杂交
四、基于PcR的指纹图谱分析
五、DNA序列分析
六、基因芯片
七、宏基因组学

第十一章 微生物分子生态学
第一节 微生物分子生态学的由来
一、自然种群结构鉴定的普遍性问题
二、利用遗传信息鉴定微生物种群的可行性

第二节 自然种群鉴定的策略
一、单细胞的直接鉴定
二、从自然样品中抽提细胞
三、从自然样品中直接抽提核酸

第三节 微生物分子生态学研究方法的优势和不足
一、微生物分子生态学研究方法的优势
二、微生物分子生态学研究方法的不足
三、展望

第十二章 微生物生态学的应用
第一节 农业微生物生态学及其应用
一、作物根系环境的微生物区系
二、土壤微生物的生态功能

第二节 医学微生物生态学及其应用
一、口腔生境特点和微生物
二、胃肠道微生物和人体健康

第三节 水生微生物生态学及其应用
一、水体基本特性
二、水体中的微生物区系
三、水体微生物的作用

第十三章 微生态学与微生态制剂
第一节 微生态学的概念
第二节 微生态学的创立与发展
第三节 正常微生物群及其与宿主的关系
一、正常微生物群
二、正常微生物群与人和动物的关系

第四节 微生态学与微生态制剂
一、微生态制剂的含义和类型
二、微生态制剂的作用机制
参考文献