《明清史研究》是关于20世纪明清历史研究的学术史，尽管会涉及明清两代客观过程，以各种历史记录载体为依据，但核心是对以往有关明清历史著述、学术研究的整体回顾与认识。20世纪是中国历史上变化剧烈、发展迅速的一个世纪。19世纪中期以来的近代化进程到20世纪开始加速，完成了由传统向现代的历史性转换。学术研究是一个时代社会文化的构成部分，同样经历、体现着这种历史的变化。
　　20世纪中国人文学科涌现出了众多的学术名家和大批的学术经典，中国的学术研究也在这一世纪从学术观念到著述形式逐步建立起现代学术思想研究的体系。研究、总结20世纪人文学科学术发展的历史，不仅是对各个学科学术研究百年成就的审视，也是对中国学术研究现代化进程的一次集体回顾，意义深远。

　　二、通论性明清史著作及其进展
　　在明清学术论著不断面世的同时，一些野史佚闻仍在社会上流传且以文本形式大量刊印、转录或再版。如中华书局出版的《清朝野史大观》一书，前述《大清见闻录》中的篇章——《太后下嫁摄政王》、《太后下嫁贺诏》、《太后下嫁后之礼制》、《世祖入五台山之原因》、《董妃董小宛说》等依然收录。①而且随着清代史料的开放，据称还找到了支持某一传闻、观点的新“证据”。例如所谓的“太后下嫁摄政王”，原有“证据”是：摄政王多尔衮称皇父；太后死后未与太宗合葬；相传当年礼部尚书钱谦益进大婚仪注；张煌言有诗“春宫昨进新仪注，大礼恭逢太后婚”等等。后来人们在整理清代礼部的殿试资料时，发现写有皇上之处，还加写有摄政王，且摄政王之上冠以“皇叔父”、“皇父”等字样；于是舆论哗然，人们更加相信顺治的母亲嫁给了多尔衮，所以才尊称其为“父”。②孟森则否定了此类说法的真实性。
　　在北京大学授课时，孟森撰有明清史讲义。《明史讲义》分为二编，分别为《总论》与《分论》，开篇以清代官修《明史》为线索，检讨其得失及研究明史方法。孟森认为，尽管《明史》为当时“知名之士”历康雍乾三朝精心编纂而成，清人对其每有赞赏，“然学者读书，必有实事求是之见”；尽管清人赵翼指出《明史》疏漏之处，其他的疏误与重复之处还可以找出一些，但这些均非关键所在，“根本之病，在隐没事实，不足传信”；官修《明史》为了隐没女真隶属明代之史实，“所系于女真者，一切削除之”。

绪论
第一章 文本与记忆（1368—1911年）
第一节 作为本朝史的明代史
第二节 明清易代与明代史
第三节 清代的本朝史
第四节 基本特征、时势更移与话语变更

第二章 转型与局限（1912—1930年）
第一节 形势变化、研究转型及重要论著
第二节 主要成绩与时代局限

第三章 深化与纷争（1931—1949年）
第一节 研究深化、领域拓展及立场分野
第二节 成就、特征与缺陷

第四章 趋同、分歧及挫折（1950—1978年）
第一节 学术环境与研究取向
第二节 基本成就与缺憾
第三节 逆转与挫折

第五章 繁荣与不足（1979—2000年）
第一节 研究方向、研究领域的拓展
第二节 学术刊物、学术队伍与学术交流
第三节 论著出版与清史概念的复原
第四节 史料的搜集、整理与公布
第五节 工具书的编纂出版

第六章 讨论与争鸣——明清史专题研究举要
第一节 政治、民族及中外关系
第二节 社会生产、经济关系诸领域
第三节 社会、思想和文化
主要参考文献
后记