《脑功能原理》各章的内容如下：第一章简单介绍研究脑功能的一些实验方法.第二章提出脑功能的知因假说与神经元簇编码假设，讨论脑功能子系统与整体网络的特性，以及脑区激活与相互作用的定律，第三章讨论感觉与动作.第四章提出意识体验的定律，讨论注意与意识，以及脑内的信息加工，第五章讨论学习与记忆，着重于工作记忆与技能学习.第六章讨论脑功能的动态过程.
    《脑功能原理》的部分章节引用了作者和合作者合写的文章（在各节中已经分别注明论文的作者、题目和发表期刊），谨对他们表示谢意.他们是（按姓名笔画为序）：王炜、孙复川、汪云九、张达人、周昌乐、郭爱克等教授，王洪田、陈湘川博士，以及万俊、江雄、张凯、谢恒等当时在学的学生.此外，引用了李恩中医师提供的资料.

第一章 脑功能实验方法
1.1 脑功能成像实验
1.2 心理学实验
1.3 心理学实验数据的定量分析

第二章 脑区激活与相互作用
2.1 脑功能知因假说
2.2 神经元簇层次性联合编码假设
2.3 脑功能子系统与脑整体网络
2.4 脑区激活与相互作用的四定律

第三章 感觉与动作
3.1 感觉系统信息处理的经验规律
3.2 不同感觉通道的相对独立性
3.3 运动的控制与执行

第四章 注意与意识
4.1 意识体验的四定律
4.2 意识涌现的相变模型
4.3 主观体验强度的公式
4.4 选择性注意的模型
4.5 脑内信息加工模式与模式转变
4.6 功能性耳鸣的中枢过敏假说

第五章 学习与记忆
5.1 学习与记忆的微观机制
5.2 短时记忆中信息的编码与提取
5.3 双重记忆原序报告的实验
5.4 短时记忆的生物物理学模型
5.5 技能学习的模型

第六章 脑功能动态过程
6.1 两种不同时间尺度的脑功能过程
6.2 脑内信息加工的量子化假说
结论
ABSTRACT
参考文献
附录