《近代名医裘吉生医文集》分为四编。第一编汇集了裘吉生先生的中医药学遗著，如学医方针、药物学、诊断学讲义和内、妇、儿各科临床专著。第二编是裘吉生先生验方选。第三编记述裘吉生先生传和年谱。第四编附录，辑入了裘氏治疗胃病的经验，叙述了裘氏1929年与中医界同仁奋起抗争当局企图限制、消灭中医的史实，继之辑入了裘氏编辑、印行的二千余种书报目录，最后收入了能客观反映史实的一些影印件、复印件。
    本医文集较全面地反映出裘吉生一代名医、教育家、出版家、医事活动家的医德风尚、学术思想，以及对中医药事业的巨大贡献。在整理过程中，为保持其原貌，原“章”“节”的编排等未作改动。
    《近代名医裘吉生医文集》不仅适用于临床医生，也是医史文献工作者重要参考著作。

第一编 裘吉生遗著
一、医论选
二、学医方针
三、药物学初阶便读
四、诊断学
五、肺痨、白喉、病疾
六、女科治疗学
七、儿科治疗学

第二编 裘吉生验方选
第三编 裘吉生传
第四编 附录
一、裘吉生先生治疗胃病的经验
二、1929年反对废止中医中药的斗争
三、裘吉生编辑和刊印的医书、医学文献目录
四、台湾出版的《增补珍本医书集成》目录
五、影印复印件