《科学思想史(第2版)》是在《科学思想史》第一版的基础上修订而成的，本次修订主要补充了爱因斯坦、玻尔之后的科学的新进展和科学发生史的一些内容，并删去了一些不太像科学思想史的叙述，使修订版更像一点科学思想史。全书共分四章，分别对古代的科学思想、16-18世纪的科学思想、19世纪的科学思想、20世纪的科学思想进行了研究和讨论。

第一章  古代的科学思想
第一节  科学的发生
一、原始自然知识
二、神话
三、巫术
四、对常识的解释

第二节  中国古代的宇宙理论
一、盖天说
二、张衡与浑天说
三、宣夜说
四、地动说

第三节  墨家的力学与物理学思想
一、墨家的力学思想
二、墨家的光学研究
三、墨家的物质观
第四节  中国的元气论

第五节  毕达哥拉斯学派的中心火学说
一、毕达哥拉斯
二、菲洛劳斯的中心火学说

第六节  亚里士多德
一、亚里士多德的运动学思想
二、亚里士多德的天文学思想
三、亚里士多德的生物学思想
四、亚里士多德的方法论思想

第七节  阿里斯塔克与托勒密
一、阿里斯塔克的曰心说
二、托勒密的地心说
三、地心说产生的认识论原因
第八节  占星术

第九节  古代的地理学思想
一、埃拉托色尼
二、辛尼加
三、斯特拉波
四、裴秀

第十节  古代的医学生理学思想
一、希波克拉底
二、盖仑
三、中国古代的医学思想

第十一节  中世纪的中国科学
一、郦道元
二、贾思勰
三、张遂
四、沈括
五、郭守敬
六、徐光启
七、宋应星

第十二节  中世纪的欧洲科学
一、神学与经院哲学的统治
二、罗吉尔培根
三、中世纪欧洲的运动学
第十三节  古代科学思想的基本特征

第二章  16-18世纪的科学思想
第一节  哥白尼
第二节  开普勒
一、布鲁诺
二、第谷
三、开普勒的行星运动三定律
四、开普勒的天体力学思想

第三节  伽利略
一、伽利略的科学精神
二、伽利略的力学思想
三、伽利略的天文学思想
四、伽利略的方法论思想

第四节  笛卡儿
一、笛卡儿的以太论与旋涡论
二、笛卡儿的物理学思想
三、笛卡儿的方法论思想

第五节  牛顿
一、牛顿的力学思想
二、牛顿的微粒说
三、牛顿的绝对时空观
四、牛顿的神学观
五、牛顿的方法论思想
六、牛顿的力学机械论
七、笛卡儿派与牛顿派的争论
……
第三章  19世纪的科学思想
第四章  20世纪的科学思想
后记