与鸟的肺脏相连有九个气囊，分别为一对颈气囊、一个锁骨气囊、一对胸前气囊、一对胸后气囊、一对腹气囊。由于鸟肺脏弹性比较差，呼吸时体积改变很小，所以听诊时呼吸音很难听道。鸟呼吸方法也与哺乳动物有很大的区别，因为它们没有膈肌，呼吸主要靠肋骨的扩张运动。前面的几个气囊比较小，呼吸时大部分气体进入到后面几个气囊。所以在鸟临床检查时，如果鸟被抓得很紧，鸟只能用有限的肺呼吸，时间长或抓得太紧会使鸟出现呼吸困难或窒息现象。鸟肺脏又分为新肺和旧肺，旧肺在呼吸中起主要的作用，气体在里面是单向运动。新肺则在鸟吸气和呼气时都有气体来回经过，气体在肺脏内停留进行交换的时间比较短。在鸟病临床上值得注意的是：鸟腹腔内的气囊与内脏相连，气囊也与鸟腹膜相连。在鸟腹腔内输液或给药时，根本不可能分清内部的这种结构，其结果是几乎与肺内注射药物或液体一样，这很容易引起鸟的窒息而造成死亡。所以，鸟绝对不能进行腹腔内输液。
五、泌尿系统
鸟蛋白质代谢终产物是尿酸盐，尿酸盐排泄需要水分比其它代谢终产物少。鸟“肾脏／体重”比哺乳动物大得多。由于鸟有肾门静脉系统，采血部位不同，化验结果也不同。输液或给药部位不同，药物所达到有效浓度的程度和所需要的时间也可能不同。鸟泄殖腔在鸟的水分保留上有很重要的意义。鸟开始产卵时摄水量比其它时期多，排泄物中水分含量也是比较高的。
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