《中兽医方剂精华》分8部分，即：方剂的理法要点，医马骡驴方，医牛羊驼方，医猪方，医犬猫方，医禽方，医其他动物（包括家兔、兽类、鱼虾、蜂、蚕等）方，通用方。除总论（方剂的理法要点）外，各论共收载方剂862个（包括附方216个）。书末备有索引以便查阅。至于每个方剂的内容，我们按顺序设计了出处、组成与制法、用法与用量、功能与主治、临床应用、相关研究、附方等句段。但限于原始材料及本书的目的，不可能一应俱全，而是以简明实用为主，宁缺勿滥；每个方剂的字数视需要而定，行文在本书宗旨及框架下也不拘一格。

前言
1 方剂的理法要点
1.1 组方法则
1.2 古今剂型
1.3 用法与剂量
1.4 比较方剂学
1.5 类方概说

2 医马骡驴方
2.1 调理强壮方
2.2 医心病方
2.3 医肺病方
2.4 医脾胃病方
2.5 医肝胆病方
2.6 医肾病方
2.7 医胎产病方
2.8 医幼驹病方
2.9 医点痛方
2.10 医疮黄方
2.11 医杂病方

3 医牛羊驼方
3.1 防治时疫寒热方
3.2 医心病方
3.3 医肺病方
3.4 医脾胃病方
3.5 医肝胆病方
3.6 医肾病方
3.7 医胎产及羔犊病方
3.8 医瘸拐方
3.9 医疮痈癣疥方
3.10 医杂病方

4 医猪方
4.1 催肥保健方
4.2 医时疫寒热方
4.3 医心肺病方
4.4 医脾胃病方
4.5 医肝肾病方
4.6 医胎产及仔猪病方
4.7 医杂病方

5 医犬猫方
5.1 医脾胃病方
5.2 医心肺肝肾病方
5.3 医虫证疥癞方
5.4 医杂病方

6 医禽方
6.1 增产保健方
6.2 医瘟疫痢痘方
6.3 医脏腑病方
6.4 医虫证杂病方

7 医其他动物方
7.1 医家兔方
7.2 医兽类方
7.3 医鱼类方
7.4 医虫类方

8 通用方
8.1 清热方
8.2 泻下消导方
8.3 解表方及和解方
8.4 除寒方
8.5 理气方
8.6 活血化瘀方
8.7 补养方
8.8 祛湿方
8.9 祛痰及治风方
8.10 固涩方
8.11 外用方
方名索引