许多应用软件提供了二次开发工具，但是大多数提供的是语言开发工具，需要专业人员进行开发。比较有特色的是开目CAPP和开目BOM软件，提供了可视化的配置工具，企业可以自行根据报表汇总的方式、表格格式和生成过程进行配置，配置方法简单实用。
为了实现客户化和解决信息孤岛问题，许多大企业专门建立了开发队伍，开发了一些自行使用的工具和模块。但是，随着应用系统日趋复杂，系统的维护越来越困难。一种新的趋势是将这种系统二次开发和维护的任务进行外包。这就产生了对专业的软件服务和系统集成商的市场需求。目前，在美国已经有大量的面向不同行业的专业软件服务和系统集成商，而在中国，由于还存在对服务价值的认同等问题，软件服务和系统集成商的发展还处于初级阶段，其角色目前主要由制造业应用软件供应商来扮演。
4）信息安全问题
信息安全问题在整个制造业电子商务解决方案中的地位日趋重要。随着企业应用信息技术的深入，产生了大量的电子文档，对这些电子文档如何存储、备份，如何保证安全，是近年来制造业企业碰到的问题。企业在指定电子商务解决方案时，也要进行充分考虑。
更为重要的是，许多企业建立了Internet，怎样才能保证Internet用户能够访问Internet，又能避免信息被盗?怎样防止网络病毒和黑客袭击?这都是企业在建立电子商务解决方案时，必须充分重视的问题。这些问题一般已经由制造业软件企业和软件与系统集成商提出了解决方案。制造业企业在方案选型时，需要充分考虑和比较各种信息安全方案，选择经济、有效的解决方案。
9.2.3 制造业企业实施电子商务的战略理念
1）实施电子商务必须与企业的发展战略紧密结合
电子商务对于制造业企业而言，是一种手段，一种工具，而不是目的。因此，制造业企业不能为了电子商务而电子商务，而是必须与企业的发展战略与经营目标结合起来，选择合适的解决方案，使得信息技术真正成为帮助企业在激烈的国际化竞争中立于不败之地的有力武器，既不能好高骛远，又不能止步不前。
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