《共产党人的旗帜》主要内容包括“三个代表”重要思想是共产党员行动的旗帜、“三个代表”重要思想的重大意义、党始终代表着先进生产力的发展要求、党始终代表先进文化的前进方向、党始终代表中国最广大人民的根本利益、“三个代表”重要思想是唯物辩证的统一整体、按照“三个代表”要求，提高党的社会影响力、按照“三个代表”要求，加强党的思想建设、按照“三个代表”要求，加强党的作风建设、按照“三个代表”要求，努力建设高素质干部队伍、按照“三个代表”要求，坚持党对军队的绝对领导、学习十六大精神，实现中华民族的伟大复兴。

第一讲“三个代表”重要思想是共产党员行动的旗帜
第二讲“三个代表”重要思想的重大意义
第三讲党始终代表着先进生产力的发展要求
第四讲党始终代表先进文化的前进方向
第五讲党始终代表中国最广大人民的根本利益
第六讲“三个代表”重要思想是唯物辩证的统一整体
第七讲按照“三个代表”要求，提高党的社会影响力
第八讲按照“三个代表”要求，加强党的思想建设
第九讲按照“三个代表”要求，加强党的作风建设
第十讲按照“三个代表”要求，努力建设高素质干部队伍
第十一讲按照“三个代表”要求，坚持党对军队的绝对领导
第十二讲学习十六大精神，实现中华民族的伟大复兴