《微生物学实验（第5版）》第5版仍遵循第3版和第4版的编写指导思想和基本要求，并按照第4版的编排模式将其分成“微生物学基本实验技术”和“微生物学综合型、研究型实验”两大部分，但对其内容和形式均进行了更新和修订。第一部分包括：无菌概念和无菌操作，消毒**，分离纯化，显微观察，涂片染色，培养基及微生物培养，生理生化反应，快速微量检测，基因突变，基因转移，基因文库构建，PCR技术及其在鉴定细菌中的应用，免疫学的基本技术等。第二部分包括：高产蛋白酶（或其他代谢产物）菌株的筛选及其基因的克隆和表达，杀虫微生物的分离，微生物产沼气，水和食品的微生物检测，酸乳、啤酒和泡菜的制作，人体表面正常菌群的分离鉴定，用互联网和计算机辅助基因分析鉴定古菌和细菌，细菌系统发育树的构建，发现和鉴定细菌新种，用来分离严格厌氧菌的“滚管实验”等。其内容涉及微生物在工业、农业、环境、食品、医学等领域的应用。
《微生物学实验（第5版）》在编写形式上仍突出了以学生为本的思想，在每一个实验中除让学生明确其目的、原理和基本操作外，还在相应位置以Box形式告知学生“本实验为什么用这种（或这些）菌株？”“安全警示”“本实验成功的关键”等。
与《微生物学实验（第5版）》配套的数字课程附有实验技术相关视频、附录和参考书目，供读者查阅和参考以及后续内容拓展与更新。
《微生物学实验（第5版）》适合理、工、农、林、医各类高等综合院校和师范院校生命科学方向本科生学习使用，也可供其他生物科技人员查阅参考。
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