本书针对当前茶叶品类单一的问题，引入传统药用植物玉叶金花，系统研究其种质资源、遗传特征、生理机制及功效成分。全书整合转录组与代谢组联合分析技术，解析玉叶金花不同叶位叶片的基因表达与代谢物动态变化规律，揭示其活性成分合成的分子机制，并建立指纹图谱。书中涵盖生物信息学方法（如WGCNA、O2PLS分析）、功能验证及产业化应用前景。 本书面向植物资源开发、茶学、生物信息学等领域的研究人员，以及特色农业产业从业者，为其提供玉叶金花基础研究与产业化应用技术的参考资料。

第一章 玉叶金花概述与研究进展
第一节 种质资源
第二节 遗传关系
第三节 生物特征
第四节 植物生理
第五节 植物成分
第六节 功效作用
第二章 生物信息学技术应用
第一节 转录组学
第二节 代谢组学
第三节 组学联合分析
第三章 玉叶金花不同叶位叶片的转录组分析
第一节 测序数据及质量控制
第二节 转录本拼接
第三节 基因功能注释
第四节 编码序列（CDS）预测
第五节 基因表达定量
第六节 差异基因筛选
第七节 差异表达基因功能注释和富集分析
第八节 转录因子注释
第九节 简单重复序列（SSR）检测及引物设计
第十节 蛋白质互作网络
第十一节 加权基因共表达网络分析（WGCNA）
第四章 玉叶金花不同叶位叶片的代谢组分析
第一节 数据结果评估
第二节 主成分分析（PCA）
第三节 正交偏最小二乘法判别分析（OPLS-DA）
第四节 代谢物含量差异动态分布
第五节 差异代谢物筛选
第六节 差异代谢物相关性分析
第七节 差异代谢物KEGG功能注释及富集分析
第五章 玉叶金花转录组与广靶代谢联合分析
第一节 主成分分析
第二节 KEGG富集分析
第三节 KGML分析
第四节 表达相关性分析
第五节 典型相关分析（CCA）
第六节 双向正交偏最小二乘法分析（O2PLS）