第1章 大数据概念、医疗大数据分类及资源
1.1 大数据概念
1.2 医疗大数据分类
1.2.1 按来源分类
1.2.2 按数据类型分类
1.3 医疗大数据资源
1.3.1 医疗机构的电子病历系统
1.3.2 基于居民健康档案的区域卫生信息平台
1.3.3 医疗卫生注册登记系统
1.3.4 医疗保险信息系统
1.3.5 互联网医疗
1.3.6 物联网医疗
1.3.7 生物组学大数据
1.3.8 医学科研文献
参考文献
第2章 医疗大数据挖掘与分析方法建立
2.1 医疗大数据挖掘需求和挑战
2.1.1 医疗数据的类型及其处理方式
2.1.2 医疗大数据挖掘的问题与挑战
2.2 医疗大数据挖掘方法
2.2.1 数据挖掘的基础方法
2.2.2 深度学习
2.2.3 预训练语言模型
2.2.4 就医行为数据挖掘方法
2.2.5 聚类分析及其在并发症分析中的应用
2.2.6 分类分析及其在预后分析中的应用
2.2.7 异常分析及其在异常就医分析中的应用
2.2.8 基于时序的疾病演化分析
2.2.9 深度学习及其在基因组学中的应用
2.2.10 预训练模型在药物发现分子表征中的应用
2.3 医疗非结构化文本数据挖掘
2.3.1 非结构化医疗文本数据的ICD编码分类
2.3.2 中文医学预训练语言模型
2.4 医疗跨模态大数据挖掘方法
2.5 多源医疗大数据挖掘
2.6 医疗数据开放互联方法
参考文献
第3章 大数据治理
3.1 专病数据库建立
3.1.1 专病数据库的构建方法
3.1.2 专病数据库的数据治理
3.1.3 一J、结
3.2 数据质量控制
3.2.1 数据质控体系概述
3.2.2 专病数据库数据质控管理
3.3 数据隐私保护
3.3.1 国内外政策／规范现况
3.3.2 数据隐私保护管理体系
3.3.3 专病数据共享的数据隐私保护策略
参考文献
第4章 临床专病数据库的建立
4.1 临床专病数据库
4.1.1 建设，临床专病数据库的意义
4.1.2 我国临床专病数据库建设
4.2 糖尿病临床专病数据库的创建及数据治理
4.3 糖尿病临床专病数据库的数据分析
4.3.1 我国及上海糖尿病的历史与现状
4.3.2 糖尿病临床数据分析
参考文献
第5章 临床大数据分析与试验设计
5.1 临床研究对象与分类
5.2 真实世界临床研究数据来源与样本量设计
5.3 定性数据简介
5.3.1 定性数据的特征
5.3.2 定性数据的主要分类
5.3.3 定性数据的可能概率分布
5.3.4 使用似然比描述定性数据
5.4 卡方独立性检验、费舍尔精确性检验和T检验
5.4.1 极大似然估计原理
5.4.2 线性回归模型和广义线性回归模型
5.5 广义线性模型和临床研究应用
5.5.1 二分类逻辑回归的临床研究统计基础知识
5.5.2 多分类逻辑回归的临床研究统计基础知识
5.6 临床研究中模型的选择、检验和判断
5.7 真实世界临床研究设计和分析的新趋势
5.7.1 仿真／模拟目标RCT
5.7.2 基于机器学习的因果推断
参考文献
第6章 医疗大数据的临床应用与科研分析
6.1 医疗大数据的整合处理
6.1.1 医疗数据的来源和类型
6.1.2 医院数据中心建设
6.1.3 医疗科研数据采集面临的问题
6.1.4 医疗大数据应用分析
6.2 医疗大数据的疾病预测与个性化诊疗
6.2.1 应用案例1：基于临床数据的患者健康风险预测与
应用实践
6.2.2 应用案例2：糖尿病健康管理与并发症预测分析
6.3 常见的临床数据库
6.3.1 MIMIC数据库
6.3.2 与MIMIC数据库配套的代码库
参考文献
第7章 生物信息学概念和数据库
7.1 生物信息学概述
7.1.1 生物信息学的发展史
7.1.2 生物信息学研究内容
7.1.3 生物信息学研究方向
7.1.4 生物信息学的应用
7.2 生物信息学常用数据库与知识库
7.2.1 生物信息学常用数据库与知识库概况
7.2.2 人类生物信息学分析主要常用数据库
7.2.3 医学信息学常用知识库
7.3 生物信息学研究的机遇和挑战
7.4 组学汇总数据的深度解读与转化利用
7.4.1 组学汇总数据
7.4.2 组学汇总数据深度解读工具XGR
7.4.3 OpenxGR：组学汇总数据在线服务工具
7.4.4 转化利用系列计算资源
参考文献
第8章 生物信息学分析方法
8.1 序列分析
8.1.1 动态规划
8.1.2 动态规划在生物信息学中的应用
8.2 基因组数据分析
8.2.1 基因组测序技术的发展历程
8.2.2 基因组重测序数据分析
8.2.3 全基因组关联研究
8.2.4 比较基因组数据分析
8.3 转录组学数据分析
8.3.1 转录组检测技术的发展历程
8.3.2 转录组数据预处理
8.3.3 差异表达分析
8.3.4 功能富集分析
8.4 转录因子与基因调控网络分析
8.4.1 转录因子的基础知识
8.4
展开
