本书共11章，具体包括：心血管系统疾病，呼吸系统疾病，消化系统疾病，内分泌与代谢系统疾病，血液系统疾病，神经系统疾病，骨骼、肌肉等运动系统疾病，生殖与泌尿系统疾病，眼、耳鼻咽喉头颈、口腔疾病，皮肤与风湿免疫性疾病，感染性疾病。每个案例包含知识点、案例、案例使用说明、启发思考题、参考文献5个部分，案例内容部分设置病例资料、相关检查、初步诊断、诊治经过、最后诊断和讨论6个方面，着力培养学生／学员疾病筛查、诊断与鉴别诊断、治疗与康复、病因与危险因素分析、预后预测等医疗决策和评价能力，达到运用理论知识指导临床实践，提高诊治决策水平和诊治质量的目的。
《临床医学案例汇编》主要聚焦临床疑难病和罕见病，案例分析具有一定的难度，但分析过程仍以“三基”教学（基础知识教学、基础技能训练、基础能力培养）为基础，注重临床思维培养，旨在为临床医学专业学位博士、硕士及住院医师规范化培训提供一本新颖、实用的案例教学教材，为提升我国临床医学专业学位研究生培养质量及住院医师规范化培训质量提供参考。本书也可作为医学其他学制、其他专业师生的教学用书或参考书使用。
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