《简明药物化学》全书共分为A～D四部分，共23个章节。其中，第1章为药物和药物作用靶标总论；第2～8章为A部分，主要概述药物靶标（蛋白质、酶、受体、信号转导途径、核酸及其他靶标）及靶向这些靶标的抑制剂，并简要介绍了药物药效学和药物代谢动力学方面的基础理论；第9～12章为B部分，总结了药物发现、设计与开发过程中的基本理论与策略；第13～20章为C部分，本部分为药物化学特定主题，精选了几大类疾病治疗药物，对其作用机制、分类方法、开发历程、合成方法、临床应用等方面内容进行了介绍；第21～23章为D部分，主要讲述了当代药物设计常用的研究方法与工具，包括组合和平行合成法、计算机辅助药物设计和定量构效关系。此外，本书每章中均插入“关键知识点”“专栏”“习题”“拓展阅读”模块，全方面加强学生对各章节内容的理解与掌握。书后有7个附录，从不同方面作为本书正文内容的支撑材料。特别是附录7“案例研究”，通过10个案例的深入拓展学习，使学生逐渐意识到药物化学已从反复试验转向了更科学的方法—在分子水平上理解疾病，然后相应地设计药物分子。 《简明药物化学》可作为药物化学、药学、药物制剂、药物分析、临床药学、制药工程等药学相关专业的本科高年级理论课教材或研究生教材；也可供从事药物化学研究相关工作的人员参考使用。

第1章 药物和药物作用靶标：总论
1.1 什么是药物？
1.2 药物靶标
1.2.1 细胞结构
1.2.2 分子水平的药物靶标
1.3 分子间相互作用
1.3.1 静电相互作用或离子键
1.3.2 氢键
1.3.3 范德华相互作用
1.3.4 偶极-偶极和离子-偶极相互作用
1.3.5 排斥相互作用
1.3.6 水的角色和疏水相互作用
1.4 药物代谢动力学和药物
1.5 药物的分类
1.5.1 根据药理作用分类
1.5.2 根据化学结构分类
1.5.3 根据靶标系统分类
1.5.4 根据靶标分子分类
1.6 药物和药品的命名
习题
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A部分 药物靶标，药效学和药物代谢动力学
第2章 蛋白质的结构和功能
2.1 蛋白质的一级结构
2.2 蛋白质的二级结构
2.2.1 α-螺旋
2.2.2 β-折叠片层
2.2.3 β-转角
2.3 蛋白质的三级结构
2.3.1 共价键：二硫键
2.3.2 离子键或静电键
2.3.3 氢键
2.3.4 范德华相互作用和疏水相互作用
2.3.5 键合相互作用的相对重要性
2.3.6 平面肽键的作用
2.4 蛋白质的四级结构
2.5 翻译和翻译后修饰
2.6 蛋白质组学
2.7 蛋白质的功能
2.7.1 结构蛋白
2.7.2 转运蛋白
2.7.3 酶和受体
2.7.4 其他蛋白质和蛋白质-蛋白质相互作用
习题
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第3章 酶和酶抑制剂
3.1 酶作为催化剂
3.2 酶如何催化反应？
3.3 酶的活性位点
3.4 底物与活性位点的结合
3.5 酶的催化作用
3.5.1 结合相互作用
3.5.2 酸碱催化
3.5.3 亲核基团
3.5.4 过渡态的稳定性
3.5.5 辅因子
3.5.6 酶的命名和分类
3.5.7 酶与遗传多态性
3.6 酶的调节
专栏3.1 一氧化氮对酶的外部调控
3.7 同工酶
3.8 酶动力学
3.8.1 米氏方程（Michaelis-Menten equation）
3.8.2 Lineweaver-Burk图
3.9 作用于酶活性位点的抑制剂
3.9.1 可逆抑制剂
专栏3.2 防冻剂中毒的治疗方法
3.9.2 不可逆抑制剂
专栏3.3 治疗肥胖症的不可逆抑制剂
3.10 作用于变构结合位点的抑制剂
3.11 反竞争性抑制剂与非竞争性抑制剂
3.12 过渡态类似物：肾素抑制剂
3.13 自杀底物
专栏3.4 自杀底物
3.14 抑制剂的同工酶选择性
专栏3.5 设计具有同工酶选择性的药物
3.15 作为药物使用的酶抑制剂
3.15.1 用作抗菌药的酶抑制剂
3.15.2 用作抗病毒药的酶抑制剂
3.15.3 用于自身酶的酶抑制剂
专栏3.6 毒素对酶的作用
3.15.4 酶调节剂
3.16 酶动力学
3.16.1 Lineweaver-Burk图
专栏3.7 激酶抑制剂
3.16.2 抑制剂的比较
习题
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第4章 受体，激动剂和拮抗剂
4.1 受体的作用
4.2 神经递质和激素
4.3 受体类型及亚型
4.4 受体的激活
4.5 结合位点的形状改变
4.6 离子通道受体
4.6.1 概述
4.6.2 结构
4.6.3 门控
4.6.4 配体门控和电压门控离子通道
4.7 G蛋白偶联受体
15.2.1 吗啡的分离
15.2.2 结构与性质
15.3 构效关系
专栏15.1 吗啡的临床应用
15.4 吗啡的分子靶标：阿片受体
15.5 吗啡：药效学和药动学
15.6 吗啡类似物
15.6.1 取代基的变化
15.6.2 药物的拓展
专栏15.2 N-烷基化吗啡衍生物的合成
15.6.3 药物结构剖析性简化
15.6.4 刚性化
专栏15.3 阿片类药物作为抗腹泻剂
专栏15.4 维诺醇类的合成
15.7 激动剂和拮抗剂
15.8 内源性阿片肽和阿片类药物
15.8.1 内源性阿片肽
专栏15.5 阿片类药物和其对阿片受体影响的比较
15.8.2 脑啡肽和δ受体选择性阿片类药物的类似物
专栏15.6 纳曲吲哚的设计
15.8.3 脑啡肽的结合理论
15.8.4 肽酶抑制剂
15.8.5 内源性吗啡
15.9 未来前景
15.9.1 “信息-地址”概念
15.9.2 受体二聚体
15.9.3 选择性阿片类激动剂与多靶标阿片类药物
15.9.4 作用于外周神经系统的阿片类药物
15.10 案例研究：纳呋拉啡的设计
习题
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第16章 抗溃疡药物
16.1 消化性溃疡
16.1.1 定义
16.1.2 病因
16.1.3 治疗
16.1.4 胃酸的释放
16.2 组胺H2受体拮抗剂
16.2.1 组胺和组胺受体
16.2.2 寻找先导化合物
16.2.3 先导化合物的发展：螯形键合理论