《温疫论》是明末医学家吴又可所撰的我国第一部温疫病专著，对后世温病学的形成与发展产生了深远影响。全书分上、下两卷，系统论述了温疫的病因、病机、临床表现、诊断要点、治疗方法和具体的方剂药物等。同时，作者创立了“戾气”病因学说，强调温疫与伤寒完全不同，并提出了许多传统中医学理论中没有的观点，对于丰富和发展中医外感病学的理论和证治做出重要的贡献。

上卷
原病
温疫初起
传变不常
急证急攻
表里分传
热邪散漫
内壅不汗
下后脉浮
下后脉复沉
邪气复聚
下后身反热
下后脉反数
因证数攻
病愈结存
下格
注意逐邪勿拘结粪
蓄血
发黄
邪在胸膈
辨明伤寒时疫
发斑战汗合论
战汗
自汗
盗汗
狂汗
发斑
数下亡阴
解后宜养阴忌投参术
用参宜忌有前利后害之不同
下后间服缓剂
下后反痞
下后反呕
夺液无汗
补泻兼施
药烦
停药
虚烦似狂
神虚谵语
夺气不语
老少异治
妄投破气药论
妄投补剂论
妄投寒凉药论
大便
小便
前后虚实
脉厥
脉证不应
体厥
乘除
下卷
杂气论
论气盛衰
论气所伤不同
蛔厥
呃逆
似表非表 似里非里
论食
论饮
损复
标本
行邪伏邪之别
应下诸症
应补诸症
论阴证世间罕有
论阳证似阴
舍病治药
舍病治弊
论轻疫误治每成痼疾
肢体浮肿
服寒剂反热
知一
四损不可正治
劳复、食复、自复
感冒兼疫
疟疫兼证
沮宅
疫痢美证
妇人时疫
妊振时疫
小儿时疫
主客交
调理法
统论疫有九传治法
正名
《伤寒例》正误
诸家温疫正误
方剂索引