第一章 肠道微生态技术概述
一、微生物组学实验技术
二、肠道微生物组作用
三、肠道微生物检测与临床应用
四、肠道微生物群标志物检测
五、肠道微生物临床应用适应证
第二章 肠道微生物组检测技术
一、检测方法
二、实验流程
(一)核酸提取
(二)文库制备
(三)上机测序
三、生物信息学分析
(一)OUT分析
(二)物种累积曲线
(三)物种丰度分析
(四)Heatmap聚类分析
(五)Alpha多样性
(六)Beta多样性
(七)ANOSIM相似性分析
(八)主坐标分析
(九)非度量多维尺度分析
(十)LEfSe分析
四、实验技术质控
五、肠道微生物组检测报告单内容
(一)总览指标
(二)菌群多样性
(三)疾病相关风险
(四)饮食、生活习惯及营养代谢能力分析
(五)肠龄预测
第三章 肿瘤治疗相关肠微生态损伤
一、肿瘤化疗对肠微生态的损伤
(一)化疗所致肠微生态损伤相关的恶心呕吐及厌
(二)化疗所致肠微生态损伤相关的口腔及胃肠黏膜炎
(三)化疗所致肠微生态损伤相关的持续性腹泻
二、化疗合并特殊并发症对肠道微生态的损伤
(一)中性粒细胞减少性发热
(二)中性粒细胞减少性小肠结肠炎
(三)化疗合并艰难梭茵感染
(四)化疗合并耐碳青霉烯酶大肠埃希菌或肺炎克雷伯杆菌感染
三、造血干细胞移植相关肠微生态损伤
第四章 肠道微生态技术与造血千细胞移植
一、HSCT概述
(一)适应证
(二)预处理及并发症
二、HSCT对肠道微生态的影响
(一)移植前预处理对肠道微生态的影响
(二)预处理引起肠道微生态失调
(三)抗生素应用与肠道菌群环境
(四)移植后CDI
三、肠道微生态对HSCT预后的影响
(一)肠道菌群与宿主免疫系统之间的相互作用
(二)进食改变和肠外营养对HSCT患者的影响
(三)肠道微生态对HSCT结局的影响
(四)肠道菌群与免疫重建及随访
四、allo-HSCT后改善肠道菌群的策略
(一)调整抗生素策略
(二)给予益生元策略
(三)益生菌的使用策略与CDI
五、急性胃肠道GVHD诊治规范
(一)分级标准
(二)诊断和鉴别诊断
(三)一线治疗
(四)二线治疗及其他治疗
第五章 肠道微生态技术与结直肠癌
一、结直肠癌肠道微生态特点
二、肠道微生态影响结直肠癌发生发展的相关机制
(一)基因毒性
(二)炎症反应
(三)免疫反应
(四)代谢
三、粪便细菌标志物与结直肠癌诊断
四、粪菌标志物与结直肠腺瘤诊断
五、其他类微生物标志物及代谢物与结直肠癌诊断
第六章 益生菌与洗涤菌群移植
一、益生菌临床前试验
(一)嗜热链球菌
(二)鸡乳杆菌
二、洗涤菌群移植
(一)洗涤菌群移植的技术背景
(二)洗涤菌群移植的实验技术
(三)WMT用于肿瘤整合治疗的适应证和禁忌证
(四)WMT用于肿瘤整合治疗的患者准备
(五)WMT用于肿瘤整合治疗的途径选择
(六)WMT用于肿瘤整合治疗的剂量和频次
(七)如何提高WMT用于肿瘤整合治疗水平
参考文献
展开