《白马湖水生态系统》一书依据近年来从事的湖泊水生态监测及评估成果，详细介绍了白马湖水生态监测工作开展情况，对白马湖的历史数据进行了比较分析，并对白马湖的健康状况进行了评估。全书共分为9章，其中第一章为湖泊概况，第二章介绍了白马湖的水环境特征，第三章至第七章分别介绍了白马湖水生高等植物群落、浮游植物群落、浮游动物群落、底栖动物群落、鱼类资源，第八章介绍了水生生物的环境响应特征，第九章对湖泊水生态系统的健康整段结果进行了描述。

1 湖泊概况
1.1 地理位置
1.2 自然地理概况
1.2.1 地质地貌
1.2.2 历史演变
1.2.3 水文气象
1.2.4 出入湖水系
1.3 社会经济概况
1.4 湖泊功能定位
1.4.1 公益性功能
1.4.2 开发性功能
1.5 资源开发利用情况
2 湖泊水环境特征
2.1 水文特征
2.1.1 降水量
2.1.2 湖区水位
2.1.3 出入湖流量
2.2 水体理化特征
2.2.1 湖区水体理化
2.2.2 出入湖河道水体理化指标
2.2.3 备用水源地水质状况分析
2.2.4 持久性有机污染物
2.2.5 历史变化分析
2.3 底泥营养盐含量
2.3.1 底泥营养盐分析
2.3.2 垂向分布特征
3 水生高等植物群落
3.1 种类组成
3.2 生物量与盖度
3.3 历史变化趋势
4 浮游植物群落
4.1 种类组成
4.2 细胞丰度
4.3 群落多样性
4.4 环境影响因子
4.5 历史变化趋势
5 浮游动物群落
5.1 种类组成
5.2 密度和生物量
5.3 群落多样性
5.4 环境影响因子
5.5 历史变化趋势
6 底栖动物群落
6.1 种类组成
6.2 密度和生物量
6.3 群落多样性
6.4 环境影响因子
6.5 历史变化趋势
7 鱼类资源
7.1 养殖区情况
7.2 鱼类资源现状
7.3 渔业资源变化趋势
8 水生生物的环境响应特征
8.1 水生生物学指数评估
8.2 监测年度内工程措施的重要影响
9 湖泊水生态系统健康诊断
9.1 现状总结
9.2 主要问题诊断
9.3 保护对策及建议
附录1 白马湖水系图
附录2 白马湖水生态监测资料汇总
附录3 白马湖大小水生高等植物图片
附录4 白马湖浮游植物鉴定图片
附录5 白马湖浮游动物鉴定图片
附录6 白马湖底栖动物鉴定图片
附录7 微型水生生物名录