第一章 动物育种学基础
第一节 基因组关联分析——单点分析
第二节 GS模型验证
第三节 育种数据模拟
第四节 G-BLUP和RR-BLUP
第五节 混合模型方程
第六节 经济选择指数
第七节 多阶段选择和Bulmer效应
第八节 方差组分和遗传力的估计
第九节 系谱群体的关系和近交
第十节 遗传漂变和近交
第十一节 动物模型
第十二节 公畜模型
第十三节 简化动物模型
第十四节 分组动物模型
第十五节 重复数据模型
第十六节 共同环境效应模型
第二章 统计计算基础
第一节 优化和解非线性方程
第二节 组合优化
第三节 方差组分估计
第四节 随机回归模型
第五节 求解混合模型方程(MME)的迭代方法
第六节 阈模型
第七节 贝叶斯线性回归模型
第八节 EM优化方法
第九节 模拟和蒙特卡洛积分
第十节 马尔可夫链蒙特卡洛
第十一节 Bootstrapping方法
第十二节 密度估计和平滑
第十三节 双变量平滑
第十四节 多元平滑
第三章 统计学习基础
第一节 简单线性回归
第二节 多元线性回归
第三节 分类方法
第四节 交叉验证和自助法
第五节 线性模型和正则化方法
第六节 支持向量机
第七节 深度学习
第八节 无监督学习
第九节 多重检验
第四章 基因组预测中的机器学习方法
第一节 线性模型
第二节 半参数方法
第三节 神经网络
第四节 验证方法
第五节 深度学习方法在基因组选择中的应用
附录 NVIDIA计算卡及相关程序安装
参考文献
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