前言
1 马鹿研究概况
1.1 研究背景
1.2 国内外研究现状及科学问题
1.2.1 马鹿的起源与分类
1.2.2 马鹿的分布与种群数量
1.2.3 马鹿种群遗传学研究
1.2.4 马鹿景观遗传学研究
1.2.5 马鹿扩散模式研究
1.2.6 东北马鹿国内研究现状
1.2.7 科学问题及创新点
1.3 研究的总目标及主要研究内容
1.3.1 研究的总目标
1.3.2 主要研究内容
2 研究地区自然概况
2.1 黑龙江双河国家级自然保护区
2.2 内蒙古高格斯台罕乌拉国家级自然保护区
2.3 黑龙江省铁力林业局施业区
2.4 黑龙江省方正林业局施业区
2.5 黑龙江穆棱东北红豆杉国家级自然保护区
2.6 吉林黄泥河国家级自然保护区
3 东北马鹿种群遗传多样性评价
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 样品采集
3.2.2 基因组DNA的提取
3.2.3 物种鉴定
3.2.4 个体识别
3.2.5 控制区序列的扩增与测序
3.2.6 数据分析
3.3 研究结果
3.3.1 物种鉴定与个体识别
3.3.2 线粒体DNA的种群遗传多样性
3.3.3 微卫星的种群遗传多样性
3.4 讨论
3.4.1 非损伤性取样
3.4.2 东北马鹿的种群遗传多样性
3.5 本章小结
4 东北马鹿种群统计学历史的揭示
4.1 引言
4.2 研究方法
4.2.1 错配分布与中性检验
4.2.2 微卫星的瓶颈效应
4.2.3 近交与有效种群大小
4.2.4 种群间迁移率分析
4.3 研究结果
4.3.1 种群的扩张
4.3.2 种群的遗传瓶颈
4.3.3 种群的近亲繁殖
4.3.4 有效种群大小
4.3.5 种群间迁移率
4.4 讨论
4.4.1 东北马鹿的分布与种群数量
4.4.2 种群扩张与瓶颈效应
4.4.3 种群的近亲繁殖
4.4.4 有效种群大小与种群间迁移率
4.5 本章小结
5 东北马鹿种群遗传结构分析
5.1 引言
5.2 研究方法
5.2.1 mtDNA数据分析
5.2.2 微卫星数据分析
5.3 研究结果
5.3.1 Cyt b基因的种群结构
5.3.2 控制区序列的种群结构
5.3.3 微卫星标记的种群结构
5.4 讨论
5.4.1 东北马鹿的种群遗传分化
5.4.2 东北马鹿的进化显著单元和管理单元
5.5 本章小结
6 景观特征对东北马鹿种群基因流的影响
6.1 引言
6.2 研究方法
6.2.1 距离隔离分析
6.2.2 环境隔离分析
6.3 研究结果
6.3.1 种群结构的距离隔离
6.3.2 种群结构的景观特征影响
6.4 讨论
6.4.1 距离隔离分析
6.4.2 景观特征对种群结构的影响
6.4.3 促进东北马鹿基因流的景观特征
6.4.4 东北马鹿基因流屏障的景观特征
6.5 本章小结
7 东北马鹿种群扩散模式研究
7.1 引言
7.2 研究方法
7.2.1 性别鉴定
7.2.2 扩散模式分析
7.3 研究结果
7.3.1 性别鉴定
7.3.2 个体间遗传距离
7.3.3 种群间遗传分化指数
7.3.4 个体间亲缘系数
7.3.5 种群的分配系数
7.3.6 个体水平的空间自相关系数
7.4 讨论
7.4.1 东北马鹿种群的性比
7.4.2 自然种群中马鹿扩散的存在与规模
7.4.3 偏性扩散检测方法及结果分析
7.4.4 东北马鹿偏雄性扩散的可能进化机制
7.5 本章小结
参考文献