如何应对工业化活动带来的环境污染和生态退化问题，是21世纪人类社会可持续发展共同面临的挑战。建立科学的水生生物多样性监测和生态健康评价方法体系，对保护水生态系统的生物完整性和生态服务功能有重要意义和价值。没有监测，一切无从谈起。利用环境DNA（eDNA）监测生物多样性及其活动是21世纪生态环境领域中最重要的技术进步之一。本书系统地介绍了近年来南京大学生态毒理与健康风险研究团队在环境DNA生物监测与水生态健康评估方面的研究成果。本书共12章，分别从生物监测基础理论、环境DNA生物监测技术、环境DNA生物评价等方面进行系统介绍。 本书可作为环境科学、资源与环境等专业高年级本科生及研究生的教学参考书，也可供从事生态环境监测与风险管理的专业人士以及从事相关领域研究的科研人员、工程技术人员参考。

丛书序
前言
第1章 绪论
1.1 生态环境变化与生物多样性危机
1.2 生物监测的需求与现有技术瓶颈
1.3 环境基因组学的发展
1.4 环境DNA开辟生态毒理学研究新时代
1.4.1 评估化学物质生态安全的环境DNA技术策略
1.4.2 环境DNA技术在生态毒理学研究和风险评估中的应用前景
1.4.3 挑战与机遇
1.5 环境DNA监测水生态系统变化与健康状况
1.5.1 环境DNA生物监测技术的原理及应用
1.5.2 跨学科合作潜在机遇
1.6 环境DNA揭示流域空间网络中完全的生物多样性结构
1.6.1 为什么要改进生物多样性数据？
1.6.2 河流网络
1.6.3 完全生物多样性
1.6.4 环境DNA评估生物多样性
1.6.5 河流独特的空间网络结构需要特定的工具
1.6.6 未来的挑战和路线图
参考文献
第2章 水生态系统生物监测基础理论
2.1 水生态系统与生物多样性
2.1.1 水生态系统
2.1.2 水生生物多样性
2.1.3 水生态系统服务与功能
2.1.4 环境压力和生物多样性丢失
2.2 生物多样性形成的理论
2.2.1 生态位理论
2.2.2 中性理论
2.2.3 复合群落理论
2.2.4 复合生态系统理论
2.3 生物多样性与生态系统功能
2.3.1 生物多样性与生态系统功能关系
2.3.2 生物多样性影响生态系统功能
2.3.3 生物多样性影响生态系统稳定性
2.4 生物多样性测度
2.4.1 目标物种监测
2.4.2 物种丰富度
2.4.3 多样性指数
2.4.4 系统发育与功能多样性
2.4.5 生态相互作用网络
2.5 水生生物监测方法
2.5.1 水生生物类群
2.5.2 生物监测技术
2.6 水生生物评价
2.6.1 国内外水环境质量监测发展历程
2.6.2 生物监测与生态环境质量评价
2.6.3 传统的生物评价指数
2.6.4 新型的环境DNA生物指数
参考文献
第3章 环境DNA技术
3.1 环境DNA技术原理
3.1.1 环境DNA来源
3.1.2 DNA条形码
3.1.3 非个体DNA的全生命过程
3.2 基于环境DNA的生物监测
3.2.1 实验设计
3.2.2 环境DNA的采集
3.2.3 环境DNA的提取
3.2.4 靶向监测
3.2.5 群落监测
3.2.6 环境DNA技术的质量控制
参考文献
第4章 浮游动物群落监测
4.1 引物选择对浮游动物多样性监测的影响
4.1.1 不同宏条形码引物对OTUs多样性的影响
4.1.2 不同引物检出浮游动物种类差异
4.1.3 不同引物对浮游动物多样性的影响
4.1.4 不同引物表征浮游动物的季节差异
4.2 枝角类浮游动物生物量监测
4.2.1 环境DNA宏条形码通用引物和qPCR物种特异性引物设计和选择
4.2.2 qPCR物种定量标准方法构建
4.2.3 验证环境DNA宏条形码方法定量物种相对丰度
4.2.4 环境DNA宏条形码与qPCR物种定量结果的比较
参考文献
第5章 浮游植物群落
5.1 环境DNA宏条形码监测浮游植物的技术规范和精准性
5.1.1 环境DNA宏条形码监测浮游植物方法的规范
5.1.2 环境DNA宏条形码监测浮游植物的精准性
5.2 环境DNA宏条形码监测高原湖泊真核浮游植物多样性
5.2.1 环境DNA宏条形码监测滇池和抚仙湖真核浮游植物组成
5.2.2 环境DNA宏条形码和传统形态学监测结果的一致性
5.2.3 环境DNA宏条形码揭示生物多样性的空间差异
5.3 环境DNA宏条形码揭示长江、太湖等水体连通生态环境效应
5.3.1 河湖连通对浮游植物群落空间分布格局的影响
5.3.2 环境DNA宏条形码技术特点
5.4 小结
参考文献
第6章 底栖动物群落
6.1 太湖本土底栖动物DNA条形码数据库构建
6.1.1 公共数据库比对
6.1.2 遗传距离分析
6.1.3 系统发育树构建
6.2 环境DNA宏条形码监测太湖底栖动物多样性
6.2.1 底栖动物多样性监测结果
6.2.2 底栖动物多样性监测结果与形态学方法的比对
6.3 环境DNA宏条形码评价太湖底栖动物完整性状态
6.3.1 底栖动物完整性指数计算
6.3.2 底栖动物完整性空间格局
参考文献
第7章 鱼类群落环境DNA监测
7.1 淡水鱼类环境DNA调查
7.1.1 研究背景
7.1.2 滤膜和采水深度对鱼类环境DNA监测的影响
7.1.3 不同引物对鱼类环境DNA监测的影响
7.1.4 环境DNA和传统调查检出鱼类种类异同
7.1.5 环境DNA和传统监测的鱼类多样性指数比较
7.1.6 环境DNA和传统监测的效率和成本对比
7.2 河口与海洋鱼类环境DNA监测
7.2.1 研究背景
7.2.2 河口与海洋鱼类环境DNA监测结果与人类活动影响评价
7.3 环境DNA鱼类监测发展趋势
参考文献
第8章 两栖动物群落
8.1 两栖动物宏条形码监测引物设计与评估
8.1.1 用于筛选的引物信息
8.1.2 不同引物扩增效果的计算分析
8.1.3 不同引物扩增效果的实验验证