本书分为八章，重点介绍了长江南京以下深水航道建设工程生态航道建设的探索，并进行了生态航道建设评价，其中，第1章背景介绍了生态文明建设的宏观要求和工程区域生态环境重点保护目标，第2章深水航道工程概况及生态环境现状介绍了工程建设概况和生态环境现状，第3章生态航道整治技术介绍了生态型护坡、生态型护底（低滩）、生态型护摊（高滩）、生态坝体结构，第4章生态环境保护及修复技术介绍了取水口及水源保护技术、江豚保护技术、人工鱼巢和生态浮床，第5章生态环境保护措施介绍了鱼类繁殖停工期设置、工程建设期环境管理、生态补偿措施，第6章生态效果监测及评估介绍了生态整治效果、生态修复效果、增殖放流效果的监测及评估情况，第7章航道工程生态影响和保护对策评估理论和技术方法介绍了推广应用成果及科技示范进展概况、航道工程生态环境影响机理与对策关键作用、航道整治鱼类生存环境影响分析技术、多层级生态环境影响综合指标体系构建与评价，第8章生态航道建设模式与对策效果评估模型介绍了生态航道建设模式构建、影响和对策效果评估模型、生态航道建设效果评价。