本专著主要依托湖北清江和尚洞野外基地，对和尚洞洞穴石笋中主要生物标志化合物的分布组成、来源及其环境气候和生态学意义进行了相关研究。我们利用细菌来源的3-羟基脂肪酸的温度和pH代用指标成功地从石笋中分离了古温度和干湿古气候信号；此外，利用长短碳链脂肪酸的单体碳同位素重建了长江中游9000年以来的古植被变化和微生物呼吸作用变化，并发现在亚热带地区陆地生态系统对暖湿气候存在负反馈作用。本专著对开展洞穴系统的分子地球生物学相关研究的人员具有一定的参考和指导意义。

第一章 洞穴古气候与古生态研究概述
第一节 洞穴系统概述
第二节 喀斯特洞穴沉积古气候研究现状
第三节 洞穴系统古生态研究现状
第二章 研究方法
第一节 索式抽提法
第二节 酸消解法
第三节 石笋酸消解法的优化
第四节 测定方法
第五节 其他新方法和新技术
第三章 洞穴系统生物标志物分布特征与来源
第一节 非羟基脂肪酸的分布特征及来源分析
第二节 羟基脂肪酸的分布特征及来源分析
第三节 GDGTs的分布特征及来源分析
第四章 洞穴系统分子地球生物学记录的古气候
第一节 古温度代用指标
第二节 干湿古气候代用指标
第三节 基于3-羟基脂肪酸代用指标的古温度和干湿古气候研究
第五章 洞穴系统分子地球生物学记录的古生态
第一节 石笋脂肪酸单体碳同位素组成
第二节 古植被重建
第三节 微生物生态系统
第四节 陆地生态系统对气候的反馈作用
主要参考文献
附 录