本书是作者第一本重要的著作，主要在晚明思想裂变的大背景下，讨论西学的传入与晚明学者的回应。作者认为，明代在王阳明以后心学流弊丛生，思想界呈“裂变”态势，如何落实道德实践成为一个最重要的难题。从晚明学术自身的发展脉络出发，以晚明的这种现实问题为基本立足点，作者讨论了西学的传入过程、策略与基本内容以及相对应的晚明学者的回应，对西学之无法解决当时的问题作出了自己的解释，对晚明学者立足儒家立场所进行的道德实践探索作出了精到的分析。

引言
第一章 晚明思想的裂变
第一节 王阳明留下的任务
第二节 封域于意识的功夫展开
第三节 良知的内外落实与流产
第四节 佛门之衰颓、改造与失效
第五节 纠弹与问题
第二章 从世俗伦理到天主实义
第一节 目的与手段
第二节 论友道
第三节 斥佛合儒的原因
第四节 天主及其存在的论证
第三章 以耶易儒或以耶补儒
第一节 以耶易儒：不可能与不必要
第二节 以西政西，以中化中
第三节 云栖袾宏的斥耶
第四节 以耶补儒：科学的与教化的
附：《辟略说条驳》的言说风格与身份意识
第四章 存于现世而面对后世的人
第一节 论灵魂
第二节 灵魂永恒的证明
第三节 人的位置
第四节 合目的与手段为一体的后世
第五章 为何破邪与如何破邪
第一节 南京教案
第二节 从行政禁抑到学理征伐
第三节 僧俗联手斥耶之自诠
第四节 全方位的破邪
第五节 破邪者的问题
第六章 《七克》：克性之谓道
第一节 《七克》的性质、文体及对儒家术语的袭用
第二节 服从上帝与后世报应
第三节 克性之谓道
第四节 改过与积善
第七章 《人谱》：成就人生之谱
第一节 回应邪说
第二节 性体及其展开
第三节 过错的产生及其分类
第四节 改过的方法
结论
参考文献
后记
再版后记
索引