软物质的物理性质对其分子结构和相互作用微观细节大多非常敏感，通常需要作连续介质假设或平均场近似等的解析方法对于软物质理论研究作用有限，因此可以精确刻画分子结构和相互作用的分子模拟方法尤为重要。然而，软物质通常具有介观的时间和空间特征尺度，往往超出了常规的分子模拟所能达到的时空范围，改进和扩展常规分子模拟方法对于软物质的理论研究而言是十分必要的。本书针对软物质理论研究的特点，大致包括了两大部分内容：第一部分介绍分子建模和模拟的基本概念和方法；第二部分介绍针对软物质研究的分子模拟领域近数十年来发展的一些技术和方法。这些方法和技术目前正在快速发展当中，本书仅介绍其中的一部分，并对少量与作者的研究工作密切相关的技术和方法做了较详细的介绍。读者需要研阅更多、更新的文献进行更全面的了解。 本书面对的读者为具有大学物理和化学基础知识的高年级本科生、研究生及青年教师，希望能对他们获取分子模拟技术知识并初步运用软物质研究中有所裨益。

丛书序
前言
第1章 绪论
1.1 软物质的定义和特征
1.2 软物质模型和模拟
1.3 增强抽样和加速模拟
1.4 总结
第2章 热力学与统计物理概要
2.1 宏观体系与微观态系综
2.1.1 微正则系综
2.1.2 正则系综
2.1.3 系综等价性
2.2 模型系统
2.2.1 理想气体
2.2.2 真实气体
2.2.3 标准溶液模型
第3章 **性原理概要
3.1 **性原理的出发点
3.2 Born-Oppenheimer近似
3.3 密度泛函方法
3.4 DFT算法在软物质研究中的简单应用
参考文献
第4章 分子建模和模拟基础
4.1 分子建模
4.2 分子模拟基本概念
4.3 蒙特卡罗方法
4.4 分子动力学模拟
4.5 简单的数据分析
4.6 分子模拟的基本技巧
参考文献
第5章 基本的优化技术
5.1 寻找局部
5.2 寻找全局
5.3 寻找优化路径
参考文献
第6章 增强抽样与加速模拟
6.1 概述
6.1.1 重要性抽样
6.1.2 增强抽样方法概论
6.2 Wang-Landau方法
6.2.1 基本原理
6.2.2 扩展应用
6.3 并行回火方法
6.3.1 基本原理
6.3.2 应用特征
6.4 Metadynamics方法
6.4.1 基本原理
6.4.2 扩展应用
6.5 广义正则系综模拟
6.5.1 基本原理
6.5.2 扩展应用
参考文献
第7章 系综模拟及数据分析方法
7.1 系综模拟数据分析方法
7.1.1 加权直方图分析法
7.1.2 马尔可夫态模型法
7.2 重加权系综动力学算法
7.2.1 方法介绍
7.2.2 算法应用及讨论
7.2.3 重加权非平衡系综动力学算法
7.2.4 小结
7.3 模拟数据分析方法
7.3.1 维数约化
7.3.2 聚类
7.4 轨迹映射算法
7.4.1 方法介绍
7.4.2 算法应用及讨论
7.4.3 轨迹映射用于增强采样
参考文献
第8章 多尺度建模和模拟
8.1 粗粒化和多尺度模拟简介
8.1.1 粗粒化建模与模拟
8.1.2 多尺度建模与模拟
8.2 自适应驱动的非平衡与多尺度模拟
8.2.1 自适应非平衡模拟
8.2.2 自适应驱动的多尺度模拟
8.3 展望
参考文献
索引
后记