本书是一本关于磁共振成像（MRI）数据分析及案例展示的工具书。全书分为九章，分别对结构磁共振成像（sMRI）、弥散张量成像（DTI）和功能磁共振成像（fMRI）的成像原理、图像采集、相关软件安装及操作，基于VBM、SBM、VBA、TBSS、功能连接和基于图论的脑网络分析等分析手段，并结合阿尔茨海默病、帕金森、精神分裂症、抑郁症、双向情感障碍和自闭症等疾病和其他认知相关研究的最新的研究成果等内容进行详细的讲解。本书以磁共振数据分析为核心，基于结构磁共振和功能磁共振的不同处理软件和相关算法，全面阐述了不同序列的磁共振数据的处理与统计分析，提供了大量已报道的经典文献案列，给读者带来MRI理论和数据分析上的革新内容。 本书内容全面，通俗易懂，适合于磁共振、心理学、神经科学、神经病学、统计学、生物信息学和计算机科学等领域的学生和研究人员学习参考。

绪论
第一节 磁共振成像发展历史
第二节 磁共振成像分析简史
第三节 磁共振成像主要研究内容
第四节 磁共振成像在神经科学中的应用
第五节 磁共振成像与其他学科的联系
第一章 磁共振成像原理
第一节 磁共振成像基本原理
第二节 扫描参数的质量控制
第三节 脉冲序列
第四节 常用成像技术
第二章 人、大鼠和树鼩脑正常结构
第一节 正常人脑解剖结构
第二节 正常人脑磁共振成像结构
第三节 正常大鼠脑解剖结构
第四节 正常大鼠脑磁共振成像结构
第五节 正常树鼩脑解剖结构
第六节 正常树鼩脑磁共振成像结构
第三章 软件介绍与安装
第一节 MATLAB下载安装与简单操作
第二节 ITKSNAP下载安装与简单操作
第三节 SPM下载安装与载入
第四节 FSL下载安装与简单操作
第五节 AFNI下载安装与简单操作
第六节 FreeSurfer下载安装与简单操作
第七节 MRIcro下载安装与简单操作
第八节 DTI Studio下载安装与简单操作
第四章 基于体素的形态学分析
第一节 数据预处理与软件准备
第二节 图像分割
第三节 创建模板
第四节 皮质、白质和脑脊液统计计算
第五节 变换到标准空间
第五章 弥散张量成像数据分析
第一节 脊髓弥散张量成像数据分析
第二节 脑弥散张量成像数据分析
第六章 静息态功能磁共振成像数据处理
第一节 数据预处理
第二节 频域信号分析（ALFF、fALFF）
第三节 局部一致性分析（ReHo）
第四节 功能连接分析
第七章 经典范例展示
第一节 磁共振成像在精神分裂症中的应用
第二节 磁共振成像在抑郁症中的应用
第三节 磁共振成像在双相情感障碍中的应用
第四节 磁共振成像在阿尔茨海默病中的应用
第五节 磁共振成像在帕金森病中的应用
第六节 磁共振成像在自闭症中的研究
第八章 基于磁共振的用于疾病诊断和分类的模型构建
第一节 基于磁共振的用于疾病诊断和分类的模型构建
第二节 基于深度学习框架构建的经典范例
第九章 医学图像在线数据库
第一节 The Cancer Imaging Archive（TCIA）
第二节 Information Extraction from Images（IXI）
第三节 MultiModel MRI Reproducibility Resource（MMRR）
第四节 International Neuroimaging DataSharing Initiative（INDI）
第五节 Open Access Series of Imaging Studies（OASIS）
第六节 MIDAS
参考文献