《大师说科学与哲学：计算机与复杂性科学的兴起》主要分两部分。第一部分讨论复杂性科学（Science of complexity）的大要、非线性系统的特色，以及计算机（尤其是超级计算机）无远弗届的影响。作者旁征博引而且花了相当的精力在各层次上予以详细说明，一般非科学背景的读者，了解这些科学的主要精神应该不会有困难。第二部分则提高层次，谈论科学与哲学之间的关联及日后的会合。作者不只对科学的哲学（包括数理哲学）有一套看法，且以自己过去的求学经验穿插其中，相当引人入胜。在这部分，广涉跨学科的认知科学、现代语言学、视觉计算理论、心物问题、进化论、分子生物学、集合论、逻辑、数学、归纳与演绎方法，包括物质与认知两类工具的有趣谈论，这些尖端学科中兴味盎然的内容，在作者娓娓道来的气氛中，让读者毫不费力地沉浸在知性与温暖的感觉中，令人觉得科学其实也是日常生活与思考的一部分。

　　★面对急遽变迁的世界局势及环境变化，创新的科学研究是解决当前众多棘手问题的重要基础。如今精选各领域的科普著作为经典套书，不但可使读者一窥历久弥坚的大师风范，领略科学与人文和谐之美，更能启发理性的思辨能力，为人类的永续发展持续追寻与努力。
　　——著名科学家翁启惠
　　
　　★既有丰富的科学与哲学内涵，又表现出浓厚的自传和逸闻色彩……
　　——《纽约时报》
　　
　　★著名物理学家帕格尔斯，再次展现他那化繁为简的独特功力，把一页页复杂难懂的科学文献，变成一篇篇简洁隽永的散文。
　　——《出版人周刊》
　　
　　★帕格尔斯对各种议题都有强烈见解，书中有许多有趣的洞见，值得科学家、计算机学家及未来学家好好思考。
　　——《图书馆杂志》

　　《大师说科学与哲学：计算机与复杂性科学的兴起》：
　　第1章 美丽的大苏尔、塞尚的苹果
　　阴茎勃起时，理性便从窗口溜走。
　　——摘自哈钦斯（Robert M．Hutchins）的幽默剧《笨瓜》（Zuckerkandl）
　　美国加州坐落在两大地壳板块之间，地质变动剧烈，虽然目前地壳相当稳定，却只是暂时的。事实上，太平洋板块正沿着圣安德烈亚斯断层、紧挨着北美大陆板块往北滑，最后在阿留申群岛附近深入地球熔岩之中。
　　加州地层的活跃，使得陆地与海洋间出现剧烈的冲突．是我生平仅见，尤其在莫罗贝之北、卡梅尔市之南的大苏尔（Big Sur）一带最为明显。这儿，圣卢西亚岭直逼海洋，千尺悬崖对着大海的惊涛骇浪。
　　大苏尔是个原始而美丽的地方，迷人之处在于它的阳光——在冬天和有雾的清晨阳光幽幽散射，夏日午后则澄澈明亮。山坡干燥的草皮在艳阳下呈金黄色，阴凉的森林满布杉柏、松树、橡树、红杉以及野生动物，海岸外是绵延的海藻床，沉浮在海浪中。岩岸间，偶尔夹着沙滩，其间充满各种海洋生物：寄居蟹、海星、海胆和鲍鱼。海鸥和鹈鹕安详地翱翔着，似乎没有进化这回事，鸬鹚则在岸边等着浮游生物吸引过来的鱼儿。
　　那里唯一的人造物是一号海岸公路，它是由一群囚犯在1930年代建造的。原本只有牧人的地方，因为这条公路而出现了人潮，其中多数是艺术家和流浪者。有一些旅馆和餐馆坐落其间，但大苏尔的孤立，以及冷寂的冬天和欠缺的工作机会，使那儿迟迟没有得到开发。
　　在东部长大的我，于1960年代来斯坦福大学读物理研究所以前，从没听说过大苏尔。那时我年方二十一，像我那样年纪的研究生常在学生活动中心门口的喷泉边流连，希望交到朋友。在那儿，我遇见了哈尔，他自陆军情报局退役以后，就成了老学生。哈尔是第二代的加州人，祖先是爱尔兰人，他黑发、碧眼，皮肤晒得很黑，跟许多爱尔兰诗人一样，是个叛逆的冒险者。
　　他对大苏尔区很熟，有次他邀我一起去那儿度个长周末。他有几辆自己改装的大众甲壳虫轿车，其中一辆把车顶切了，在切口处加上木条，然后为车装上强力的保时捷引擎，看来活像装了轮子的澡缸——好快的澡缸！我们就坐着这辆澡缸上路去。
　　我们走的是一条小道（哈尔似乎知道所有的路），穿过向日葵田，海水的咸味飘浮在空气中。在蒙特雷湾，我们花了整个早上探看那些老制罐厂，它们生产的鱼罐头曾喂饱了第二次世界大战期间的英国人！功成身退之后，就被废弃在那儿任海浪侵蚀。这儿是小说家斯坦贝克（John Steinbeck）的家乡，一个人吃人、聚集失败者的地方（拜斯坦贝克小说之赐，现在有些制罐厂被整修后成了观光中心）。
　　哈尔认识一些意大利渔夫，他们还记得湾里充满鱼虾的光景。在那些日子里，当地餐厅的海鲜都是由他们供货的。
　　我在哪里？
　　经过蒙特雷湾之后，我们从一号公路经过卡梅尔、洛沃斯角．通过苏尔岬的灯塔，直入圣卢西亚岭，海浪在悬崖下不断拍打着。四周出奇地安静，我们好像跨过了门槛，回到了原始时代。但是。我在哪里？
　　丹麦哲学家克尔恺郭尔（Soren Kierkegaard）曾说：“生命的无奈，在于走过方知来时路。”回想起来，在我生命中的那段时光，走访大苏尔是很有意义的——自然的力量激发我思考自己的存在。
　　我那时是个年轻的理想主义者，口若悬河，对人类充满希望。而在研究所，我攻读最具挑战性的高能物理和量子场论（quantum field theory）。除了研究物理，我想象不出还有什么事可做。像其他在战后富裕中成长的一代一样，金钱对我来说似乎没什么必要，也没有多大意思，我要追寻的是：智识理念、解决问题和名声。
　　那时候，西岸的大学从东岸争聘了许多名教授。斯坦福大学正计划建造巨型线性加速器（linear accelerator），将电子加速撞向约3．2千米外的靶子。在那儿，物理学家将要发现核子的组成粒子——夸克（quark）；另一方面，生物学家专注于解出遗传密码．进行着生命问题的基本研究；心理学家则正拓展认知的新领域：计量经济学（econometrics）也诞生了；而电机工程师正深入电子控制与信息系统的理论。
　　1950年代末期，活力四射的校长特曼（Fred Terman）争取到修改法令，使大学也能租地皮设立工业区，那就是硅谷的前身。他使得技术界和财经界的关系日益密切，促成了斯坦福附近的高科技发展。在圣克拉拉，他们砍掉杏树来建房子和办公室。一场将改变都市人口、经济力量、战争方式、就业形态的计算机革命即将爆发。
　　除了理论物理，我也被其他智识，例如哲学和艺术所吸引。我开始学画，尝试弄清楚画家都在做些什么，也想改变我的视觉感受和习惯。在所有的画家之中，塞尚（Paul Cezanne）最早让我了解了用不同的方法去看这个世界，而人类的视觉经验往往是文化的产物。
　　一位叫凯彻姆的朋友，经常在家里举行艺术和哲学讨论会。在那儿，我开始读康德和胡塞尔（Edmund Hussel）。从室友和同学那儿，我学到计量经济学、分子生物学和生物化学。在学校里，我旁听一些课程（为兴趣，而不是为学分）。记得有一门课，分析哲学家戴维森（Donald Davidson）对一群大学生解释塔斯基（Alffed Tarski）有关真理的语法观念。我们分析的是这样的句子：“雪是白的，当且仅当雪是白的。”我从来没有真正了解过真理的语法观念，也没搞懂语言哲学的多层次真实意义。不过，这并不是哲学老师的错。
　　我猜我是学了太多物理，以至毁了我的哲学灵气。物理太讲实际了，物理学家常很快区分出物理和数学。数学是研究物理的语言形式，那些着迷于数学之美而不见事物之理的理论物理学家，总使我想到那些忽略了语言到底在描述什么事物的语言哲学家。每当我问起到底语言哲学家在做些什么时。我得到的回答使我相信他们和语言学家做一样的事——了解怎么用字。
　　……

前言 新世界观
第1章 美丽的大苏尔、塞尚的苹果

第一部 复杂性科学
第2章 科学的新综合体
第3章 秩序、复杂性与混沌
第4章 生命可以是如此非线性
第5章 模拟真实世界
第6章 联结论与神经网络
第7章 钱赚得愈来愈快

第二部 哲学与反哲学
第8章 造物主的造物密码
第9章 等待救世主
第10章 错以脑为心的人
第11章 躯体从不说谎
第12章 向无限挑战
第13章 创造的工具

第三部 结论
第14章 理性之梦