本书校点整理工作以季会明钞本和乾隆本为底本，参校徐建极钞本、陈泓钞本等多种钞本、印本，约请褚绍唐、吴应寿二位先生整理、校点。书中涉及大量人名和地名，为方便读者阅读，凡人名和地名均标以专名线。本书整理者还特赴广西、云南、贵州踏勘徐霞客旅行路线，实地校核《游记》记述及有关地名，为《徐霞客游记》中一些难以索解的问题，标校不当之处，乃至解决季会明抄本的某些阙脱，提供了可靠依据。
校点说明
季序
徐序
卷一上
游天台山日记浙江台州府
游雁宕山日记浙江温州府
游白岳山日记徽州府
游黄山日记徽州府
游武彝山日记福建建宁府崇安县
游庐山日记江西九江府
游黄山日记后
游九鲤湖日记福建兴化府仙游县
卷一下
游嵩山日记河南河南府登封县
游太华山日记陕西西安府华阴县
游太和山日记湖广襄阳府均州
闽游日记前
闽游日记后
游天台山日记后
游雁宕山日记后
游五台山日记山西太原府五台县
游恒山日记山西大同府浑源州
卷二上
浙游日记
江右游日记
卷二下
楚游日记
卷三上
粤西游日记一
卷三下
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