中医理论体系中，还有一些疑难或有争议问题需要深入探讨。例如：整体观念为何只在中医学中有？人体之气与宇宙本原之气有无区别？三焦是腹中的六腑之一还是人体上中下部位的划分？燥邪是属阴还是属阳？阴虚水肿能用“阳气与阴液”这一对阴阳关系解释的了吗？咽干声嘶乏力诊断为气阴两虚合理吗？等等。孙广仁主编的《孙广仁中医基础理论讲稿》，将这些疑难问题一一详解或讨论，起到了解惑的作用，并可启发学生或读者探究问题的兴趣，培养他们的探索能力。

绪论
一、中医学的概念和学科属性
二、中医学理论体系的概念、形成和发展
三、中医学理论体系的主要特点
四、中医基础理论课程的主要内容
第一章  中医学的哲学基础
第一节  精气学说
一、古代哲学精与气的概念
二、精气学说的内容
三、精气学说在中医学中的应用
第二节  阴阳学说
一、阴阳的概念
二、阴阳学说的基本内容
三、阴阳学说在中医学中的应用
第三节  五行学说
一、五行的概念
二、五行学说的基本内容
三、五行学说在中医学中的应用
第四节  中医学的思维方式
一、中医学思维方式的产生基础
二、中医学常用的思维方式
第二章  精气血津液神
第一节  精
一、人体之精的基本概念
二、人体之精的代谢
三、人体之精的功能
四、人体之精的分类
第二节  气
一、人体之气的基本概念
二、人体之气的生成
三、人体之气的运动与气化
四、人体之气的功能
五、人体之气的分类
第三节  血
一、血的基本概念
二、血的生成
三、血的运行
四、血的功能
第四节  津液
一、津液的基本概念
二、津液的代谢
三、津液的功能
第五节  神
一、人体之神的基本概念
二、人体之神的生成
三、人体之神的分类
四、人体之神的作用
第六节  精气血津液神之间的关系
一、气与血之间的关系
二、气与津液之间的关系
三、精血津液之间的关系
四、精气神之间的关系
第三章  藏象
第一节  藏象学说概论
第四章  经络
第五章  体质
第六章  病因
第七章  发病
第八章  病机
第九章  防治原则