秦玉琪，山东大学国家糖工程技术研究中心，长期从事真核生物遗传学和功能基因组学的研究、特别侧重于真核生物转录调控的研究，对转录调控参与真核生物发育以及组蛋白修饰参与染色质重构具有深入研究。

　　无论在健康还是疾病研究领域，基因表达的调控几乎是所有生物学过程的基础。《基因调控机制》旨在将当前对基因表达调控机制的认知加以浓缩概述，不仅对经典的转录机器、转录调控、信号转导及染色质修饰等进行了精细深入的阐释，而且着重定位于描述后基因组时代的基因调控。《基因调控机制》体现了当前国际上基因表达调控研究的水平和动向，英文原著在国际学术界有较大影响，可供生物学、基础医学等学科的研究生学习和参考。

第一篇概述1
第1章介绍：什么是基因表达？3
1.1分子生物学的中心法则3
1.2基因转录的复杂性7
1.3转录调控元件8
1.4染色质活动在基因调控中的作用11
1.5基因表达程序12
1.6主要概念14
拓展阅读15
第2章染色质的功能16
2.1常染色质和异染色质16
2.2核小体19
2.3染色质开放和封闭时的组蛋白修饰22
2.4组蛋白修饰的基因组效应25
2.5染色质结构28
2.6表观遗传信号对健康和疾病的影响30
2.7主要概念32
拓展阅读33
第二篇转录因子篇35
第3章基础转录机器37
3.1核心启动子37
3.2TATA框42
3.3核心启动子元件44
3.4TFⅡD作为多蛋白复合物的范例46
3.5基因组范围内识别核心启动子的方法47
3.6中介复合物49
3.7主要概念52
拓展阅读53
第4章转录因子54
4.1位点特异性转录因子54
4.2转录因子结构域55
4.3二聚体化的转录因子复合物：核受体异源二聚体的例子59
4.4生物信息学方法识别转录因子结合位点61
4.5转录因子表达谱64
4.6转录因子的分类66
4.7主要概念68
拓展阅读70
第5章信号转导与基因调控71
5.1潜在转录因子的激活72
5.2转录因子网络74
5.3转录因子调控的程序性细胞分化76
5.4NFKB信号途径79
5.5炎症反应中的转录因子83
5.6感应细胞压力：p53途径85
5.7主要概念88
拓展阅读89
第6章基因表达开关：核受体的例子90
6.1核受体超家族90
6.2核受体的分子间相互作用93
6.3核受体的生理作用96
6.4核受体及其配体98
6.5核受体和辅因子的相互作用100
6.6主要概念102
拓展阅读103
第7章基因组作图104
7.1进化足迹法104
7.2ENCODE计划107
7.3ENCODE计划的数据挖掘109
7.4整合ChIPseq数据111
7.5转录因子的其他DNA结合模式113
7.6转录因子与靶基因的匹配115
7.7主要概念118
拓展阅读119
第三篇染色质篇121
第8章染色质修饰因子123
8.1组蛋白密码模型124
8.2组蛋白修饰酶128
8.3组蛋白标记的全基因组分析和它们的修饰酶132
8.4染色质修饰和疾病135
8.5主要概念137
拓展阅读139
第9章基因组印记140
9.1绝缘子140
9.2基因组调节器CTCF142
9.3基因组印记144
9.4绝缘子功能模型147
9.5CTCF介导的染色质结构的遗传148
9.6主要概念149
拓展阅读151
第10章表观基因组152
10.1DNA甲基化152
10.2基因组范围的DNA甲基化154
10.3DNA甲基化、异染色质和基因沉默156
10.4健康与疾病中的表观基因组学160
10.5主要概念163
拓展阅读164
第11章染色质重塑165
11.1染色质重塑的作用165
11.2ATP依赖的重塑复合物167
11.3启动子上的核小体定位170
11.4先锋因子173
11.5转录动力学和噪声175
11.6主要概念177
拓展阅读178
第12章染色质结构180
12.1细胞核的组织180
12.2高级DNA环结构的形成182
12.3细胞核内的分区185
12.4转录工厂186
12.5核定位与疾病188
12.6主要概念188
拓展阅读189
第四篇非编码RNA篇191
第13章调控RNA193
13.1非编码RNAs193
13.2miRNA及其功能195
13.3长链非编码RNA199
13.4eRNA201
13.5miRNA和转录因子介导的基因调控203
13.6主要概念204
拓展阅读206