五世达赖喇嘛是西藏历史上富有政治远见和能力的宗教领袖，被称为“伟大的五世”。他与蒙古和硕特部首领固始汗联合统一西藏，建立甘丹颇章政权，又在清朝建立不久进京觐见顺治皇帝，加强与中央政府的联系。1652年五世达赖喇嘛进京觐见时，顺治皇帝专门在北京修建了黄寺供其驻锡。1654年他返藏途中，顺治帝赐金印金册予以册封，确立了达赖喇嘛在西藏的宗教领袖地位。
五世达赖喇嘛时期最重要的营建工程是筑造布达拉宫。1645年五世达赖喇嘛下令修建布达拉宫，作为其居住和理政的场所，1653年布达拉官白宫竣工。1682年五世达赖喇嘛圆寂后，第悉桑结嘉措主持建造了布达拉官红宫。在五世达赖喇嘛身前和身后共历时十余年，完成了布达拉宫这组巍峨庄严的伟大建筑，它是西藏政教合一体制的最典型的物化表现，是西藏高超的建筑水平的集中体现，也是拉萨城市景观的重要支点。
五世达赖喇嘛时期还建造了一些贵族宅邸，如他为蒙古部落首领固始汗建造的宅邸（桑珠颇章大院），不过这一时期更多的是围绕大昭寺逐渐建造的各类民居和商铺，拉萨城区的建筑密度和人口密度都所有增加。
（二）五世达赖喇嘛以后的营建活动
五世达赖喇嘛之后，拉萨城内各类建筑继续被建造，使得拉萨城区在大昭寺和八廓街地区及布达拉宫地区以外，还向外围进行了局部扩展，主要是修建了与达赖喇嘛活动有关的园林，如六世达赖喇嘛时期修建的宗角禄康、七世达赖喇嘛时期修建的罗布林卡，这些令人心旷神怡的优美园林，至今都是拉萨的瑰宝。
自七世达赖喇嘛起，历世达赖喇嘛家族都在拉萨拥有宅邸，这些宅邸被称为“尧西府”，是最高一级贵族的院落。除了达赖喇嘛家族的宅邸，在八廓街附近还陆续建造了一些贵族家宅。在西藏和平解放前，拉萨老城内保留有48座贵族大院。
在拉萨老城区的各类建筑中，尧西府和其他贵族宅邸是十分独特的，它们直接与拉萨政治中心的地位紧密相关，但由于贵族总数不多，因而其所占的比重并不太高，大量的建筑是普通民宅、商铺。不过，在老城区内纯粹的商铺并不太多，大多是商住合一的建筑，底层为商铺，二、三层为仓库或居室。这些设施虽不直接与行政中心功能发生关系，但却是为包括贵族和行政人员在内的所有居民服务的，是拉萨老城区综合功能的组成部分。
三驻藏大臣制度的确立与延续
五世达赖喇嘛定都拉萨后，开创了拉萨重新作为行政、宗教和商业中心的时代，直到他1682年圆寂，拉萨度过了四十年和平安定的时光。但是，在五世达赖圆寂后的半个多世纪中，西藏充满权力争斗与社会跌宕，拉萨各种势力的角逐也十分激烈，特别是西藏地方势力和中央政府、蒙古部落的关系错综复杂，发生了许多重大的历史事件，推动着中央政府加强对西藏的治理，规范中央政府与西藏地方的关系，以及西藏地方政权的结构。
第一，第悉与汗王之争。拉萨政坛最初的争斗始于第悉桑结嘉措与郡王拉藏汗之间，康熙四十四年（1705年），拉藏汗执杀桑结嘉措，之后清政府封拉藏汗为“翊法恭顺王”。在拉藏汗向清政府奏禀假喇嘛、谋反等罪名下，六世达赖喇嘛仓央嘉措及桑结嘉措之妻被押解进京，1707年拉藏汗另立了新的六世达赖喇嘛意希嘉措，在位11年，经历了一个由蒙古势力主导的短暂时期。由于西藏局势特殊，清政府认为不便由拉藏汗独掌西藏事务，便于康熙四十八年（1709年）派侍郎赫寿前往西藏协同拉藏汗办理藏事，这是驻藏大臣制度的酝酿与肇端。
第二，汗王被杀、七世达赖喇嘛坐床、噶伦制度建立。尘埃甫定动荡又至，1717年拉藏汗被来自新疆的蒙古准噶尔部策妄阿拉布坦的军队所杀，在此情况下，康熙皇帝先后两次派兵平息西藏局势，平定准噶尔之乱，定乱之后于1720年七世达赖喇嘛从青海被迎请至拉萨坐床。1721年清政府在西藏设立噶伦制度，由三名（后增设两名）噶伦共同执政，命拉藏汗女婿康济鼐为首席噶伦，总管西藏事务，办公地点在大昭寺南门楼上。
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