职能部门战略，又称职能层战略，是为贯彻、实施和支持总体战略与经营单位战略而在企业特定的职能管理领域内制定的战略。它是企业内部主要职能部门的短期战略计划，使职能部门的管理人员可以更加清楚地认识到本职能部门在实施企业总体战略中的责任和任务，有效地运用研究开发、营销、生产、财务、人力资源等方面的经营职能，从而保证实现企业目标。
职能部门战略一般可分为营销战略、人力资源战略、财务战略、生产战略、研发战略、公关战略等。从战略管理的角度来说，职能部门战略的核心在于：贯彻企业的总体目标；职能目标的论证及其细分化，如规模与生产能力、主导产品与品种目标、质量目标、技术进步目标、市场目标等；确定职能部门战略的战略重点、战略阶段和主要战略措施；战略实施中的风险分析和应变能力分析。
职能部门战略应在研究开发、生产作业、市场营销、财务会计和人力资源管理等职能部门中制定。各职能部门的主要任务不同，关键变量也不同；即使在同一职能部门里，关键变量的重要性也因其经营条件不同而有所变化，难以归纳出一般性的职能层战略。
从战略构成要素来看，协同作用和资源配置是职能战略的关键要素，而经营范围的重要性较低。协同作用是在单个的职能中协调各种活动，并将这些活动联合起来。
职能部门战略与企业总体战略之间的区别主要有以下几个方面：
其一，期限。职能部门战略用于确定和协调企业短期的经营活动，期限较短，一般在一年左右。职能部门战略期限较短的主要原因是：第一，职能部门管理人员可以根据总体战略的要求，把注意力集中在当前需要进行的工作中；第二，职能部门管理人员可以更好地认识该部门当前的经营条件，及时适应发生变化的条件，并做出相应的调整。
其二，具体性。企业主要职能部门的战略要比企业总体战略更加具体。总体战略为企业指出一般性的战略方向，而职能战略则为负责完成年度目标的管理人员提供具体指导，使他们知道如何实现年度目标。同时，具体的职能战略还可以增强职能部门管理人员实施战略的能力。
具体性之所以能使职能部门战略获得成功，主要有三点原因：第一，具体性在战略中增加了实际内容，明确了企业内职能部门必须完成的工作，从而丰富和完善了战略；第二，具体的职能战略向企业高层管理人员阐明各职能部门准备如何实施总体战略，可以增强企业高层管理人员实施与控制总体战略的信心；第三，具体的职能部门战略可以说明企业中各职能部门间相互依赖的战略关系以及潜在的矛盾，有利于促进各职能部门的协调。
其三，职权与参与。企业高层管理人员负责制定企业的长期目标禾口总体战略。职能部门的管理人员经过总部的授权，负责制定年度目标和部门战略。职能部门管理人员参与制定职能战略，可以更自觉地实现本部门的年度目标，执行职能战略需要进行的工作，增强实施战略的责任心。
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