交易所债券市场与银行间债券市场目前存在的一些问题
鉴于交易所债券市场与银行间债券市场在交易方式、投资者结构与结算及托管上存在一些显著的差异，这些差异不可避免地导致两个市场在债券定价、流动性和波动性等方面产生相应的影响。
1. 国债定价上的问题
同一国债品种在交易所债券市场与银行间债券市场同时发行与上市交易，但是，由于两个债券市场的交易机制不尽相同，交易所的交易系统实行集合竞价，根据价格优先、时间优先的原则撮合定价，银行间市场采取的是询价交易方式，一对一成交并定价，可能引发的问题就是相同的国债品种，两个市场的成交价格存在着一定的差异，因此两个市场也将呈现出不同的收益率曲线。在两个市场高效联通的情况下，国债在两个市场之间的瞬间转入与转出，并在两个市场实现实时的交易，可以将两个市场的价格差异缩小，在套利交易收益等于套利成本时达到均衡，最终两个市场的收益率曲线相当接近。
如果交易所债券市场与银行间债券市场存在着定价上的显著差异，两者的收敛机制如何，是哪一个市场具有支配地位的单项引导，还是有主次的相互引导？张颖(2012)的研究发现，两个市场收益率具有较大的相关性，但是交易所市场收益率期限结构较为陡峭，而银行间市场收益率期限结构较平坦。交易所国债收益率时间序列与银行间国债收益率时间序列在期限较短时相互影响、互为因果，但银行间收益率变化单向领先于交易所收益率变化更为显著。潘婉彬等人(2007)认为国债价格和交易量在两个不同市场的关系，交易所市场在价格方面起着先导作用，而银行间市场在交易量上起着先导作用。杨兵兵(2012)的研究表明，在2009年之前，两个市场之间只存在从交易所债市到银行间债市单向因果关系，两个市场存在较弱联动性；2009年商业银行重返交易所债市后，银行间债市对交易所债市影响有所增强，两市场变成互为因果关系。上述研究结果表明，两个市场更可能互为因果，存在着双向的引导关系。
2. 国债波动性上的问题
国债定价上的问题直接决定了国债波动性的问题。正如一个硬币的正反面，价格是正面，波动性是反面，波动性反映了债券价格的变化。由于中国存在交易所债券市场和银行间债券市场，两个市场的投资者和交易机制不完全相同，在对同一债券存在定价上的差异导致了债券波动性的不同。譬如，在交易所市场实行的是集中撮合竞价交易制度下，价格发现更为快捷，一旦市场得到影响债券价格的因素发生变化的消息，由于流动性的问题，债券价格瞬间发生较大的变化，而在银行间债券市场实行一对一的询价报价与做市商制度下，即便市场接收到了影响债券价格因素变化的消息，国债价格的波动相比较交易所债券市场要低一些。
在交易所债券市场与银行间债券市场存在着波动性显著差异的情况下，两个市场的波动性是否存在一致性的变化，即在同一消息影响下，两个市场是否会出现波动性的非一致性？比如，在消息开始在债券市场传播时，两个市场投资者的异质性可能会导致两个市场的交易价格出现偏离。在以大户和中小机构主导的交易所市场上，投资者的情绪较不稳定并缺少理性，投资者的盲从和羊群效应导致价格上蹿下跳，价格波动性大，市场稳定性差，而以商业银行为主导的银行间市场，对于产生的同一消息，分析得较为理性，不会根据该消息进行相应的买入或卖出，从而该消息不会影响到债券价格，或者对债券价格的影响非常小，在一段时间后，债券价格就会向均值回归。
3. 国债流动性上的问题
国债流动性的高低直接影响了债券的价格，进而影响到债券的波动性，因而两个债券市场的流动性在一定程度上决定了两个市场的定价差异。国债流动性受到多种因素的影响，包括投资者结构、交易制度与交易方式、信息透明度、交易成本、托管与结算效率等，其中投资者结构与交易制度对国债流动性的影响更大。从银行间债券市场与交易所债券市场投资者结构看，以商业银行为主导的投资类机构和以中小金融机构为主导的交易类机构是两个市场的最大区别。通常意义上看，投资类机构以持有到期为主，对债券的流动性要求不是特别看重，会降低市场流动性供给，交易类机构往往通过买进与卖出调整资产组合，会提高市场的流动性供给与需求。
从交易机制来看，交易所债券市场实行竞价交易制度，债券流动性供给与需求完全由买卖双方根据价格自行提供，在正常交易状态下，市场流动性不会成为问题，但是，竞价交易的一个最大问题是在非正常交易状态下，如市场出现大幅度波动，无论是价格上升或者下降，都可能导致买方和卖方突然消失，导致流动性黑洞的出现。在做市商制度下，做市商一方面充当债券市场的卖方，同时充当债券市场的买方，其双向提供债券流动性，有效平衡了流动性供给与需求的缺口，确保了交易者在所有价位上的买入和卖出指令得到执行。在做市商制度下，交易者根本没有必要担心交易对手的突然消失，极大地提高了市场的流动性，从这个意义上看，银行间债券市场流动性要高于交易所债券市场。但是，目前双边报价商制度离国外真正的做市商制度还差得很远，如更多成交是以成员间相互谈判、直接达成交易为主，没能有效地建立做市商制度降低了银行间债券市场流动性
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