体质病机学是研究不同体质在疾病过程中作用机理的学说。
现先举一些临床现象。同一个地区、同一时期流行的感冒，虽然病原体是相同的，但其临床表现却见很多不同的类型。例如除一般感冒所共有的发热、咳嗽、喷嚏、头痛等症状以外，有些患者则啬啬恶寒较为明显，且其口不渴、尿清长、面色咣白，而有些患者则口干、便秘、尿黄短少、面色潮红等比较突出；有些患者则胃脘痞满，头重如裹，四肢倦怠，舌苔厚腻较为显著。这是因为患者的体质不同，其发病的过程不同，所反映的症状也不同。
大量的中西医结合的临床实践已经积累了不少同病异证的资料。如肺结核患者，或为肺阴虚，或见肺气虚，或见阴虚火旺。肝炎患者可见肝郁气滞者，肝胆湿热者，肝脾不和者，肝肾阴虚者，血瘀者。病源是相同的，为什么临床类型又如此之不同？当然其中部分原因可能是病程早晚不同，但更主要的可能是与患者体质类型不同有关。
吴又可在《温疫论》中曾以酒醉为喻，论及体质因素与发病类型之关系。他说：“邪之着人，如饮酒然。凡人醉酒，脉必洪而数，气高身热，面目皆赤，乃其常也。及言其变，各有不同。有醉后妄言妄动，醒后全然不知者；有虽沉醉而神思终不乱者；有醉后应面赤而反刮白者；应痿弱而反刚强者；应壮热而反恶寒战栗者；有易醉易醒者；有难醉而难醒者；有发呼欠及喷嚏者；有头眩眼花及头痛者。因其气血虚实之不同，脏腑禀赋之各异，更兼过饮少饮之别，考其情状，各自不同，至于醉酒则一也，及醒时诸态如失。凡受疫邪，始则昼夜发热，日晡益甚，头痛身痛，舌上白苔，渐加烦渴，乃众人之常也。及言其变，各自不同，.或呕、或吐、或咽喉干燥，或痰涎涌甚，或纯纯发热，或发热而兼凛凛，或先凛凛而后发热……种种不同，因其气血虚实之不同、脏腑禀赋之有异，更兼感重感轻之别。考其证候，各有不同，至论受邪则一也。及邪尽，诸证如失。所谓知其一万事毕，知其要者一言而终，不知其要者流散无穷，此之谓也。”由此可见，中医理论认为，个体体质与发病类型亦有密切之关系。我们认为，其决定因素不在于病因，而在于从热化者体素阴虚，从寒化者体素阳虚。这是由于病因相同，体质不同，出现了不同的证。
异病同证亦可能与体质有关。大量的中西医结合的临床实践也已积累了不少资料。肝炎、胃十二指肠溃疡病、肝硬化、慢性肾炎、再生障碍性贫血、红斑狼疮等都可以显现肝肾阴虚的临床类型。慢性结肠炎、肝硬化、慢性肾炎、再生障碍性贫血有时又都可以显现脾肾阳虚的临床类型。这是目前还不能满意地用现代医学所已知的病理学来解释的现象，这可能是由于病因不同、体质相同，所以出现了相同的证。由此可以认为，体质是形成“证”的物质基础之一。
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