前言
上篇 植物基因组同源区研究背景知识
1 植物比较基因组学研究进展
1.1 禾本科植物比较基因组学研究进展
1.2 十字花科植物比较基因组学研究进展
2 生物信息学软件在基因组测序和注释中的应用
2.1 生物信息学定义
2.2 基因组学研究中常用的生物信息学软件
2.2.1 序列组装与质量检测
2.2.2 序列注释
3 基因组测序与植物分子育种
3.1 基因组定义
3.2 基因组测序策略
3.2.1 BACby。BAC法
3.2.2 全基因组霰弹法
3.3 关于基因组测序完成标准
3.4 DNA测序新方法
3.4.1 454测序系统(GS系统)
3.4.2 GenomeAnalyzer测序系统
3.4.3 SOL,iD测序系统
3.4.4 DNA测序技术回顾、总结与展望
3.5 基因组信息在植物分子育种中的应用
4 生物倍性进化与新基因形成
4.1 生物多倍体化与重新二倍体化
4.2 新基因形成
4.2.1 外显子重排(exonshuffling)介导的新基因形成
4.2.2 基因复制(geneduplication)介导的新基因形成
4.2.3 反转录转座(retrotransposon)介导的新基因形成
4.2.4 可移动元件(mobileelement)介导的新基因形成
4.2.5 横向基因转移(lateral genetransfer)介导的新基因形成
4.2.6 基因断裂/融合(gene fusion/fission)介导的新基因形成
4.2.7 从头形成(de novo origination)
下篇 稻属植物分蘖控制基因MOC1同源区比较研究
5稻属植物分蘖控制基因MOC1同源区研究选题依据
5.1 水稻遗传改良上面临的主要问题
5.2 解决问题的突破口
5.3 稻属植物分蘖控制基因MOCI同源区研究的重要性
6稻属概况及其基因组学基础
6.1 稻属分类概况及栽培稻起源
6.1.1 稻属分类研究进展
6.1.2 栽培稻起源
6.2 稻属植物基因组学基础
6.2.1 稻属植物染色体组型的确定
6.2.2 稻属不同染色体组型间的亲缘关系
7野生稻中的优异基因与利用
7.1 野生稻中的优异基因
7.2 野生稻中优异基因的利用
7.2.1 抗病性
7.2.2 抗虫性
7.2.3 抗非生物胁迫性
7.2.4 品质
7.2.5 产量性状
7.2.6 细胞质雄性不育基因
8稻属MOC1同源区研究手段
8.1 研究材料及工具
8.1.1 植物材料
8.1.2 载体及菌株
8.1.3 分子生物学试剂
8.1.4 仪器设备
8.2 研究方法
8,2.1 植物材料的培养
8.2.2 基因组DNA的提取
8.2.3 质粒DNA的提取
……
参考文献
附表
缩略词
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