全书由微生物的基础知识（第一章至第七章）和微生物与食品的利害关系（第八章至第十章）两部分组成，包括绪论和10章分述。第一章至第四章讲述原核微生物、真核微生物、非细胞生物及微生物的营养与培养基相关知识。第五章为微生物的代谢，将微生物机体复杂的生物化学变化问题，也是学生一时难于理清的问题，人为地分为微生物的酶、微生物的呼吸作用与能量代谢、微生物的分解代谢和微生物细胞物质的合成4个方面来讲述，使其更容易理解。第六章把微生物生长的环境条件要求直接与食品环境联系起来，使学生迅速领悟到食品与微生物的密切关系。第七章从微生物遗传的物质基础、基因突变和诱变育种、基因重组与杂交育种3个方面来介绍微生物遗传变异与育种知识。第八章至第十章讲述食品生产与微生物、食品变质与微生物和食品卫生与微生物，将食品微生物知识直接应用于食品从原料到产品生产的各个环节，便于学生理解。
